More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01753 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  100 
 
 		 419 aa  840    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  45.05 
 
 		 384 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  46.58 
 
 		 389 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  41.58 
 
 		 407 aa  263  6e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  38.07 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  38.11 
 
 		 388 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  37.24 
 
 		 390 aa  229  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  35.7 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  35.44 
 
 		 464 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  35.7 
 
 		 385 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  35.7 
 
 		 385 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  35.7 
 
 		 385 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  32.41 
 
 		 399 aa  193  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  35.44 
 
 		 385 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  35.79 
 
 		 388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  33.16 
 
 		 390 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00480  conserved hypothetical protein  27.8 
 
 		 684 aa  161  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06227  aminotransferase family protein (LolT), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13295)  27.66 
 
 		 470 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64026  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  25.12 
 
 		 421 aa  134  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.867854  normal  0.0377472 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61494  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  24.18 
 
 		 430 aa  129  8.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0727802 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  34.91 
 
 		 461 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0174  aminotransferase class V  35 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0764904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  27.51 
 
 		 437 aa  123  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  23.2 
 
 		 438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  29.49 
 
 		 469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  26.42 
 
 		 437 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  23.48 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  30.21 
 
 		 476 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  27.22 
 
 		 422 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46105  predicted protein  29.31 
 
 		 485 aa  109  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  32.05 
 
 		 462 aa  108  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  32.23 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  29.07 
 
 		 460 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3487  selenocysteine lyase / isopenicillin N epimerase  32.91 
 
 		 426 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0293361  normal  0.0990887 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  31.4 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2611  aminotransferase, class V  29.44 
 
 		 441 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  32.99 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  26.57 
 
 		 427 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  26.57 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  28.82 
 
 		 393 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  31.79 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  27.65 
 
 		 433 aa  96.7  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  32.49 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  30 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  23.35 
 
 		 368 aa  94.4  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  28.57 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  32.74 
 
 		 381 aa  92.8  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  28.17 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  27.27 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  30 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  25.11 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  30.6 
 
 		 395 aa  90.5  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  25.4 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  28.26 
 
 		 495 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.3 
 
 		 429 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  25.18 
 
 		 393 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.23 
 
 		 429 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  37.7 
 
 		 395 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.23 
 
 		 429 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  28 
 
 		 372 aa  86.3  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  32.77 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.98 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  27.81 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  30.81 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3786  aminotransferase, class V  27.45 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  28.63 
 
 		 488 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  27.23 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0027  aminotransferase class V  28.16 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  26.12 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  28.2 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4214  aminotransferase, class V  26.67 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  28.81 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0791  putative L-cysteine/cystine lyase  31.78 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51384  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.04 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1642  aminotransferase, class V  26.92 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  31.21 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.62 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  28.79 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  27.3 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  24.5 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  36.07 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  27.35 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  26.82 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  32.5 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  28.37 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  26.87 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3538  aminotransferase class V  26.59 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.29 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  32.2 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2273  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.48 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  35.16 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  34.5 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  28.81 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  30 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.72 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.87 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.63 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  28.35 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.96 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>