More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1377 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  100 
 
 		 390 aa  801    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  84.79 
 
 		 388 aa  689    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  73.06 
 
 		 399 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  48.97 
 
 		 385 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  48.97 
 
 		 385 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  48.97 
 
 		 385 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  48.97 
 
 		 464 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  48.72 
 
 		 385 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  48.72 
 
 		 385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  41.34 
 
 		 389 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  40.57 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  38.13 
 
 		 399 aa  255  9e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  36.99 
 
 		 419 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  35.25 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  33.95 
 
 		 388 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  32.14 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  25.79 
 
 		 428 aa  159  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  24.29 
 
 		 438 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06227  aminotransferase family protein (LolT), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13295)  31.68 
 
 		 470 aa  143  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0174  aminotransferase class V  30.15 
 
 		 389 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0764904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46105  predicted protein  29.02 
 
 		 485 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3487  selenocysteine lyase / isopenicillin N epimerase  29.72 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0293361  normal  0.0990887 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  27.06 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00480  conserved hypothetical protein  29 
 
 		 684 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  33.78 
 
 		 393 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.57 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  27.39 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.82 
 
 		 429 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.72 
 
 		 429 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  25.76 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  30.13 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  28.87 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  25.62 
 
 		 429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.45 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.5 
 
 		 418 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.73 
 
 		 441 aa  116  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.11 
 
 		 429 aa  116  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  27.19 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  25.67 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.67 
 
 		 434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  29.71 
 
 		 476 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.03 
 
 		 442 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.43 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64026  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  22.57 
 
 		 421 aa  113  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.867854  normal  0.0377472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.18 
 
 		 425 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.5 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  24.74 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  27.39 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.23 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.17 
 
 		 404 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.44 
 
 		 427 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  26.14 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.11 
 
 		 434 aa  110  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  24.14 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  24.94 
 
 		 405 aa  109  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  33.5 
 
 		 380 aa  109  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26810  cysteine desulfurase  25.57 
 
 		 409 aa  109  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  25.52 
 
 		 437 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  24.94 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.54 
 
 		 433 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  28.82 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21910  cysteine desulfurase  29.04 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  26.16 
 
 		 387 aa  106  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  26.8 
 
 		 408 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  30.16 
 
 		 460 aa  106  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  26.98 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.91 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.62 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.26 
 
 		 409 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  23.19 
 
 		 569 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.88 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.75 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  25.06 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.75 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  29.24 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  28.21 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  26.01 
 
 		 414 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  27.2 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61494  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  21.88 
 
 		 430 aa  103  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0727802 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  24.31 
 
 		 394 aa  103  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  25.06 
 
 		 416 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  21.32 
 
 		 376 aa  102  9e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  24.44 
 
 		 393 aa  102  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.58 
 
 		 608 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  24.2 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  27 
 
 		 462 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.81 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.95 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  29.54 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.16 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  21.49 
 
 		 445 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  24.21 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  24.21 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  24.21 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.56 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  26.35 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  24.21 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  26.23 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  27.35 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  25 
 
 		 416 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>