More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0174 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0174  aminotransferase class V  100 
 
 		 389 aa  756    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0764904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3487  selenocysteine lyase / isopenicillin N epimerase  53.95 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0293361  normal  0.0990887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  40.7 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  37.03 
 
 		 388 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  35.71 
 
 		 407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  34.2 
 
 		 385 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  34.2 
 
 		 464 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  34.2 
 
 		 385 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  34.2 
 
 		 385 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  34.2 
 
 		 385 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  33.94 
 
 		 385 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  29.52 
 
 		 384 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  30.13 
 
 		 389 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  30.21 
 
 		 399 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  31.51 
 
 		 388 aa  156  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  30.57 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  32.63 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  31.25 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46105  predicted protein  28.39 
 
 		 485 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916775  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06227  aminotransferase family protein (LolT), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13295)  30.54 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  25.33 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  26.43 
 
 		 462 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  30.23 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  29.13 
 
 		 460 aa  97.4  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  27.39 
 
 		 469 aa  95.5  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  25.1 
 
 		 428 aa  90.1  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  25.6 
 
 		 476 aa  89.7  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  24.9 
 
 		 461 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  27.31 
 
 		 422 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  28.28 
 
 		 495 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  27.5 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64026  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  23.72 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.867854  normal  0.0377472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  23.6 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  22.45 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  23.59 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.96 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  28.06 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  24.6 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  28.63 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.67 
 
 		 413 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  26.44 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  24.19 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2611  aminotransferase, class V  28.66 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.12 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  30.65 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.88 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.95 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  23.66 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.55 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61494  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  23.36 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0727802 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  26.61 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  23.1 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  26.9 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.88 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  25.35 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3786  aminotransferase, class V  25.59 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.43 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  27.03 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  28.38 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  25.75 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  26.47 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.04 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  29.45 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.4 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.74 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.69 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  24.24 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  21.37 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.283231  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  27.27 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  24.36 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00480  conserved hypothetical protein  22.14 
 
 		 684 aa  68.9  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.31 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.37 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.9 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.51 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.82 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  25.65 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  24.26 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.52 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.82 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1852  twin-arginine translocation pathway signal  24.26 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776832 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.76 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  30.93 
 
 		 424 aa  67  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  27.12 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  26.04 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  26.04 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  23.76 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  23.92 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.81 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  22.16 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  28.74 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  23.2 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  21.63 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  23.2 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.98 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  23.76 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  23.2 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.98 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.11 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>