More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4777 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  100 
 
 		 391 aa  789    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  33.6 
 
 		 384 aa  199  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  35.87 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  31.39 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  29.37 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0484  aminotransferase class V  32.8 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  29.11 
 
 		 379 aa  146  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  28.95 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  27.27 
 
 		 381 aa  143  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  28.76 
 
 		 387 aa  142  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  31.94 
 
 		 374 aa  140  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  27.37 
 
 		 378 aa  139  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  28.87 
 
 		 379 aa  135  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  26.86 
 
 		 368 aa  135  9e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0305  aminotransferase class V  26.86 
 
 		 373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0304  aminotransferase class V  26.6 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  25.58 
 
 		 387 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0309  aminotransferase class V  26.86 
 
 		 373 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0300  aminotransferase class V  26.86 
 
 		 373 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3208  kynureninase  29.5 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  27.6 
 
 		 371 aa  126  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  26.41 
 
 		 416 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  27.22 
 
 		 373 aa  125  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  25.97 
 
 		 377 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  32 
 
 		 355 aa  125  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2025  aminotransferase class V  32.84 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  29.63 
 
 		 394 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  26.59 
 
 		 374 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  30 
 
 		 370 aa  124  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  26.59 
 
 		 374 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2100  kynureninase  28.9 
 
 		 422 aa  122  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0759  hydrolase protein  28.42 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  29.6 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  26.19 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4470  kynureninase  28.03 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37610  kynureninase  29.88 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  27.42 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1353  kynureninase  31.4 
 
 		 423 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0734  kynureninase  29.08 
 
 		 416 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3228  kynureninase  27.88 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  26.45 
 
 		 378 aa  119  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  28.42 
 
 		 367 aa  119  7e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1156  kynureninase  29.29 
 
 		 435 aa  119  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2118  kynureninase  28.61 
 
 		 409 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.489178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1389  kynureninase  28.18 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0130616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2650  kynureninase  28.57 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  31.76 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0709  kynureninase  27.84 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.540456  normal  0.132012 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0775  kynureninase  27.84 
 
 		 417 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0679  kynureninase  31.27 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  29.06 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0822  kynureninase  27.72 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.632925  hitchhiker  0.00000920194 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0808  kynureninase  28.8 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  25.2 
 
 		 373 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3452  aminotransferase, class V  24.43 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.237823  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  30.89 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1432  kynureninase  28.3 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0731734  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  26.8 
 
 		 401 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  32.41 
 
 		 347 aa  109  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  27.2 
 
 		 411 aa  110  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  26.39 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2225  kynureninase  28.26 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.810346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  24.35 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  26.58 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  29.1 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  28.21 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0411  aminotransferase, class V  23.7 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  27.55 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  26.4 
 
 		 377 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  27 
 
 		 377 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7639  kynureninase  28.77 
 
 		 409 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.84 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3396  kynureninase  29.68 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337289  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  26.46 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3511  kynureninase  27.2 
 
 		 427 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3019  kynureninase  28.76 
 
 		 425 aa  103  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  25.38 
 
 		 393 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.64 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2602  kynureninase  28.72 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0787  kynureninase  28.68 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  26.81 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1473  kynureninase  26.85 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  24.04 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1967  kynureninase  28.72 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2578  kynureninase  28.72 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.649182  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3589  kynureninase  27.7 
 
 		 453 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0099  kynureninase  28.13 
 
 		 416 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0352  kynureninase, putative  28.13 
 
 		 416 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.543237  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0710  kynureninase  27.11 
 
 		 416 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0491742  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5192  kynureninase  28.01 
 
 		 409 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491737 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2486  kynureninase  28.13 
 
 		 416 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0651  kynureninase  28.13 
 
 		 416 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.131802  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1542  kynureninase  30.49 
 
 		 423 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0917927  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02180  Kynureninase  28.3 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.641919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.42 
 
 		 414 aa  100  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1448  kynureninase  28.18 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83502  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  23.68 
 
 		 896 aa  99.4  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2497  kynureninase  28.46 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.651765  normal  0.855444 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0507  kynureninase  25.8 
 
 		 416 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0151824 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2085  kynureninase  27.6 
 
 		 395 aa  99.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.867817  normal  0.374512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>