More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0008 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  100 
 
 
376 aa  759    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  56.95 
 
 
381 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  53.44 
 
 
411 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  52.79 
 
 
401 aa  359  3e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  47.86 
 
 
377 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  50.27 
 
 
377 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  50.67 
 
 
377 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  51.37 
 
 
377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  50.27 
 
 
377 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  50.55 
 
 
377 aa  321  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  47.59 
 
 
372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  37.67 
 
 
379 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  35.91 
 
 
387 aa  199  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  35.77 
 
 
378 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  30.83 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  30.29 
 
 
368 aa  182  9.000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  29.81 
 
 
376 aa  182  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  30.69 
 
 
394 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  29.23 
 
 
394 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  29.03 
 
 
384 aa  145  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  28.95 
 
 
391 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  31.71 
 
 
355 aa  143  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  28.65 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  29.1 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  29.16 
 
 
367 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  31.99 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  29.67 
 
 
415 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.03 
 
 
406 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  27.6 
 
 
387 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  30.21 
 
 
381 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  26.05 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  29.19 
 
 
393 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  30.08 
 
 
401 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  29.17 
 
 
395 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  30.6 
 
 
381 aa  116  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  25.94 
 
 
410 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  30.48 
 
 
414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2118  kynureninase  28.28 
 
 
409 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.489178 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.97 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.37 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  28.87 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  25.32 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0484  aminotransferase class V  27.88 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  28.98 
 
 
437 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  25.71 
 
 
394 aa  112  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.89 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  24.15 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  25.59 
 
 
410 aa  110  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26810  cysteine desulfurase  26.28 
 
 
409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  29.39 
 
 
404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.18 
 
 
404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3396  kynureninase  29.75 
 
 
413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.42 
 
 
409 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.24 
 
 
408 aa  110  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  28.46 
 
 
387 aa  110  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  26.48 
 
 
382 aa  110  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  25.32 
 
 
425 aa  109  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  28.36 
 
 
377 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  24.94 
 
 
392 aa  109  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.72 
 
 
672 aa  109  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.72 
 
 
674 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  26.7 
 
 
417 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  26.02 
 
 
398 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  24.34 
 
 
380 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.67 
 
 
415 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  28.8 
 
 
414 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  25.26 
 
 
406 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  25.26 
 
 
406 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  25.26 
 
 
406 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.86 
 
 
605 aa  107  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  25.26 
 
 
406 aa  106  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  25.26 
 
 
406 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  25.26 
 
 
406 aa  106  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  29.25 
 
 
341 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  25.26 
 
 
406 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.35 
 
 
411 aa  106  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.12 
 
 
414 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  24.21 
 
 
381 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  25.32 
 
 
394 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  26.83 
 
 
416 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.98 
 
 
429 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  28.21 
 
 
428 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  26.82 
 
 
381 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0399  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.07 
 
 
429 aa  105  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  25 
 
 
406 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  31.96 
 
 
287 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.07 
 
 
429 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  25.25 
 
 
405 aa  104  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.72 
 
 
418 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.41 
 
 
673 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  25 
 
 
406 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.29 
 
 
406 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  25 
 
 
406 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  27.67 
 
 
896 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  29.05 
 
 
387 aa  103  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  27.18 
 
 
393 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.91 
 
 
451 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0679  kynureninase  28.91 
 
 
413 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.2 
 
 
664 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  30.38 
 
 
374 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>