More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1250 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  100 
 
 		 372 aa  761    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  57.02 
 
 		 401 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  52.82 
 
 		 411 aa  350  3e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  52.96 
 
 		 377 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  50 
 
 		 377 aa  346  4e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  52.56 
 
 		 377 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  50.82 
 
 		 377 aa  339  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  50.54 
 
 		 381 aa  338  9.999999999999999e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  49.87 
 
 		 377 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  47.59 
 
 		 376 aa  325  6e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  50.27 
 
 		 377 aa  323  4e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  37.33 
 
 		 379 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  37.86 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  34.71 
 
 		 387 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  28.41 
 
 		 376 aa  150  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  28.45 
 
 		 368 aa  150  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  30.48 
 
 		 379 aa  146  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 387 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  29.87 
 
 		 416 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  29.79 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  34.89 
 
 		 347 aa  119  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  31.69 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  27.73 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  25.4 
 
 		 381 aa  116  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  27.05 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  28.46 
 
 		 384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  26.81 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  30.15 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  31.01 
 
 		 382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  29.25 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  28.2 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  30.18 
 
 		 380 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13338  hypothetical isopenicillin N epimerase  25.91 
 
 		 361 aa  109  9.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  28.24 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  28 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  28.46 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  25.64 
 
 		 392 aa  106  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  30.64 
 
 		 345 aa  106  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.12 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  29.48 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  31.27 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.53 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.44 
 
 		 406 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.44 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  23.57 
 
 		 422 aa  103  6e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  26.11 
 
 		 403 aa  102  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  29.43 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.56 
 
 		 429 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03589  aminotransferase, class V superfamily  27.15 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.301675  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.56 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  25.8 
 
 		 407 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  27.02 
 
 		 394 aa  99.8  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  27.54 
 
 		 379 aa  99.8  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  27.25 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  26.8 
 
 		 382 aa  98.6  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.33 
 
 		 409 aa  98.2  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  23.86 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  29.25 
 
 		 362 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  27.08 
 
 		 380 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.64 
 
 		 406 aa  97.1  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  28.85 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.86 
 
 		 407 aa  96.7  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  29.49 
 
 		 380 aa  96.7  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.32 
 
 		 406 aa  96.7  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.17 
 
 		 407 aa  96.7  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.14 
 
 		 412 aa  96.3  7e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  25.87 
 
 		 401 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  25.72 
 
 		 399 aa  96.3  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.99 
 
 		 406 aa  96.3  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  28.14 
 
 		 414 aa  95.9  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  28.42 
 
 		 384 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  28.61 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.76 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.99 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  28.15 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.63 
 
 		 429 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  30.31 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  27.99 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  27.34 
 
 		 400 aa  94.4  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  27.99 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.99 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.9 
 
 		 406 aa  94  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  27.55 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.99 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  26.41 
 
 		 430 aa  93.6  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  26.45 
 
 		 394 aa  93.6  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.99 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  29.64 
 
 		 880 aa  93.2  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  24.18 
 
 		 381 aa  93.2  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  26.42 
 
 		 406 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  26.42 
 
 		 406 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.67 
 
 		 406 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.85 
 
 		 406 aa  93.2  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  29.54 
 
 		 382 aa  92.8  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  26.42 
 
 		 406 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.56 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  25.31 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  27.73 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0484  aminotransferase class V  29.55 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  24.73 
 
 		 395 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>