More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1785 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  100 
 
 		 347 aa  686    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1799  aminotransferase, class V  90.49 
 
 		 347 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  56.65 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  54.99 
 
 		 362 aa  349  4e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2385  aminotransferase class V  53.61 
 
 		 357 aa  306  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00212379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  48.07 
 
 		 345 aa  286  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  45.09 
 
 		 352 aa  260  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1463  aminotransferase class V  50 
 
 		 352 aa  258  2e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3072  aminotransferase class V  49.56 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237704  decreased coverage  0.0000000313902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0028  hypothetical protein  49.7 
 
 		 368 aa  255  7e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0933  aminotransferase class V  47.48 
 
 		 351 aa  244  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0698  aminotransferase, class V  45.81 
 
 		 347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0712  aminotransferase, class V  45.81 
 
 		 347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0520963 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0692  aminotransferase, class V  46.11 
 
 		 347 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0756141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5841  aminotransferase class V  48.94 
 
 		 333 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17260  selenocysteine lyase  39.88 
 
 		 413 aa  206  5e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.118877  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14510  hypothetical protein  46.22 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  33.15 
 
 		 389 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  34.89 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  32 
 
 		 381 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  35.23 
 
 		 384 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  35.23 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  32.96 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  35.23 
 
 		 384 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  32.2 
 
 		 411 aa  112  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  32.62 
 
 		 381 aa  102  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  34.35 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  27.69 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  27.15 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  26.2 
 
 		 387 aa  99.4  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  27.07 
 
 		 378 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  32.1 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  31.06 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  31.91 
 
 		 374 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  24.29 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  31.64 
 
 		 401 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  27.43 
 
 		 387 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  32.6 
 
 		 355 aa  89.7  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  27.22 
 
 		 379 aa  89.4  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  31.94 
 
 		 377 aa  87  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  25.62 
 
 		 374 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  27.86 
 
 		 377 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  29.66 
 
 		 367 aa  85.9  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  24.86 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  28.29 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  25.62 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  26.04 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  24.09 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  28.65 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1308  aminotransferase class V  26.5 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  29.82 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  29.26 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  29.67 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  27.62 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  25.82 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  24.49 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  26.12 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  29.37 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.37 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0300  aminotransferase class V  24.37 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0305  aminotransferase class V  24.65 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.95 
 
 		 433 aa  79.3  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  29.65 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  29.37 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  26.99 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.37 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  28.66 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0309  aminotransferase class V  24.09 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4022  aminotransferase class V  27.09 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0304  aminotransferase class V  24.09 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  27.88 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  27.56 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0280  cysteine desulfurase family protein  35.91 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155667  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0489  probable cysteine desulfurase  24.48 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  25.53 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  27.45 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  30.59 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  26.51 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  26.18 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.87 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0199  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.01 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.36 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  31.82 
 
 		 425 aa  72.8  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  22.07 
 
 		 381 aa  72  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  25.9 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  23.18 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.36 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.43 
 
 		 657 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  25.93 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.56 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  27.01 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  23.95 
 
 		 896 aa  70.9  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.66 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  25.88 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  28.25 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  31.43 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.16 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  24.92 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.6 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  26.57 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>