More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1463 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1463  aminotransferase class V  100 
 
 		 352 aa  685    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  46.71 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  45.75 
 
 		 341 aa  249  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  50 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1799  aminotransferase, class V  49.54 
 
 		 347 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2385  aminotransferase class V  44.44 
 
 		 357 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00212379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0028  hypothetical protein  42.41 
 
 		 368 aa  212  7e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17260  selenocysteine lyase  39.04 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.118877  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  38.33 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0933  aminotransferase class V  43.12 
 
 		 351 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3072  aminotransferase class V  43.1 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237704  decreased coverage  0.0000000313902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  41.27 
 
 		 345 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0698  aminotransferase, class V  41.45 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0712  aminotransferase, class V  41.45 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0520963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5841  aminotransferase class V  40.52 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0692  aminotransferase, class V  41.45 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0756141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14510  hypothetical protein  40.93 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  28.86 
 
 		 387 aa  99.4  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  30 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  30.7 
 
 		 381 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.39 
 
 		 408 aa  90.9  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0199  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.61 
 
 		 403 aa  89.4  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1322  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.58 
 
 		 439 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  30.7 
 
 		 355 aa  87  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.53 
 
 		 414 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  25.17 
 
 		 392 aa  85.9  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  30.82 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  26.43 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  31 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  28.18 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  32.35 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.83 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.18 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  27.68 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  26.15 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  31.89 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  25.57 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  31.69 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  30 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  26.73 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  26.72 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2118  kynureninase  28.04 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.489178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.48 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  25.75 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.07 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.59 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.93 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.33 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  25.75 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  28.44 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.33 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  24.41 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.04 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  31.28 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  25.07 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.63 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  24.1 
 
 		 896 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  28.52 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0669  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.49 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.700717  normal  0.366803 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  30.33 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.92 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  25.82 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.22 
 
 		 432 aa  75.9  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1308  aminotransferase class V  24.66 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  26.82 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  24 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  26.49 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  24.57 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.8 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  27.13 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.54 
 
 		 644 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.36 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  26.39 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  29.38 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  28.1 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  24.73 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.18 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.54 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  28.41 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.35 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  25.1 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  24.44 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  26.89 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.69 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.4 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  30.15 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1473  kynureninase  27.4 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.5 
 
 		 674 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  30.05 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.5 
 
 		 672 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3452  aminotransferase, class V  25.23 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.237823  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  23.64 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.78 
 
 		 605 aa  73.2  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.56 
 
 		 415 aa  72.8  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.87 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  20.67 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.9 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  22.47 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.64 
 
 		 664 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.62 
 
 		 429 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>