More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1799 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1799  aminotransferase, class V  100 
 
 		 347 aa  681    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  90.49 
 
 		 347 aa  610  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  60.69 
 
 		 341 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  54.7 
 
 		 362 aa  354  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2385  aminotransferase class V  52.17 
 
 		 357 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00212379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  49.55 
 
 		 345 aa  296  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  45.38 
 
 		 352 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1463  aminotransferase class V  49.54 
 
 		 352 aa  263  4e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0028  hypothetical protein  50 
 
 		 368 aa  256  6e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3072  aminotransferase class V  48.09 
 
 		 357 aa  251  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237704  decreased coverage  0.0000000313902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0698  aminotransferase, class V  46.41 
 
 		 347 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0712  aminotransferase, class V  46.41 
 
 		 347 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0520963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0933  aminotransferase class V  46.88 
 
 		 351 aa  242  7.999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0692  aminotransferase, class V  46.71 
 
 		 347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0756141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5841  aminotransferase class V  48.64 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17260  selenocysteine lyase  39 
 
 		 413 aa  202  7e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.118877  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14510  hypothetical protein  48.74 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  33.7 
 
 		 389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  33.02 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  31.3 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  32.79 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  32.79 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  31.86 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  32.79 
 
 		 384 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  28 
 
 		 377 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  32.77 
 
 		 372 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  33.13 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  31.06 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  33.24 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  26.48 
 
 		 387 aa  99.4  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  27.35 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  27.15 
 
 		 384 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  29.57 
 
 		 381 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  30.13 
 
 		 377 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  25.94 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  26.29 
 
 		 387 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  30.4 
 
 		 374 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  29.46 
 
 		 403 aa  93.6  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  31.18 
 
 		 381 aa  92.4  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  29.04 
 
 		 377 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  27.86 
 
 		 377 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  29.43 
 
 		 377 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  24.29 
 
 		 376 aa  90.1  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  27.55 
 
 		 379 aa  89.7  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  28.33 
 
 		 377 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  32.42 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  23.44 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1308  aminotransferase class V  26.23 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  25.52 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  26.8 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0489  probable cysteine desulfurase  24.48 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  24.02 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  26.61 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  26.65 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  26.37 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  27.83 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  31.61 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  23.22 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  26.16 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  27.96 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  26.88 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.39 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  24.79 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  28.35 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0280  cysteine desulfurase family protein  35.36 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  27.61 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  27.76 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  24.05 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  26.07 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  27.06 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.35 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  25.38 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.06 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  24.8 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  25.85 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  30.74 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  27.69 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  27.19 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0300  aminotransferase class V  24.86 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  26.6 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0305  aminotransferase class V  24.86 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  25.58 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0309  aminotransferase class V  24.58 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  27.25 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  21.76 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0199  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.03 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  28.53 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4022  aminotransferase class V  27.53 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.09 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0304  aminotransferase class V  24.3 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.03 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.18 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  25.36 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.19 
 
 		 657 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  28.67 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  22.83 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.68 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  26.18 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.48 
 
 		 441 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  24.22 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>