More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4343 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  94.78 
 
 
384 aa  675    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  94.79 
 
 
384 aa  673    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  100 
 
 
384 aa  744    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  76.66 
 
 
389 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  35.01 
 
 
381 aa  160  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  29.52 
 
 
380 aa  159  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  35.64 
 
 
381 aa  155  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  34.77 
 
 
377 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  34.71 
 
 
355 aa  152  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  31.23 
 
 
398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  30.52 
 
 
378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  32.11 
 
 
381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  30.24 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7397  Selenocysteine lyase  31.13 
 
 
382 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03589  aminotransferase, class V superfamily  30.79 
 
 
393 aa  123  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.301675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  30.81 
 
 
377 aa  122  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  32.28 
 
 
377 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  33.06 
 
 
362 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  35.5 
 
 
347 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  28.35 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  31.35 
 
 
377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  29.02 
 
 
377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  27.69 
 
 
368 aa  116  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  26.95 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  24.67 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5353  aminotransferase class V  32.97 
 
 
380 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  30.77 
 
 
401 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  30.36 
 
 
379 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  31.32 
 
 
345 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  29.09 
 
 
391 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  32.08 
 
 
352 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  28.04 
 
 
416 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  30.55 
 
 
374 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  26.26 
 
 
387 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  25.49 
 
 
392 aa  100  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1799  aminotransferase, class V  32.88 
 
 
347 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  32.2 
 
 
287 aa  99.8  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  28.23 
 
 
372 aa  99.4  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  29.97 
 
 
341 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.16 
 
 
403 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  26.25 
 
 
394 aa  99  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  29.22 
 
 
372 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  30.49 
 
 
379 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  31.25 
 
 
395 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  37.35 
 
 
406 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  29.04 
 
 
402 aa  97.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  23.94 
 
 
438 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.33 
 
 
406 aa  95.9  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  27.75 
 
 
367 aa  95.9  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  29.17 
 
 
393 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.9 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  30.43 
 
 
380 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  28.9 
 
 
377 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.42 
 
 
413 aa  94  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.42 
 
 
413 aa  94  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  28.61 
 
 
406 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  30.73 
 
 
383 aa  93.6  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  30.98 
 
 
380 aa  93.2  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3060  aminotransferase, class V  31.12 
 
 
407 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.349128  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  30.87 
 
 
387 aa  92.8  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3773  aminotransferase class V  32.22 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  26.36 
 
 
384 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  31.03 
 
 
393 aa  92  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  30.63 
 
 
376 aa  92  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  33.5 
 
 
393 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  23.1 
 
 
393 aa  90.9  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  27.41 
 
 
407 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  30.77 
 
 
395 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  28.01 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  27.97 
 
 
382 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  24.42 
 
 
413 aa  90.5  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21910  cysteine desulfurase  35.96 
 
 
435 aa  90.5  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2273  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.98 
 
 
442 aa  90.1  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0028  hypothetical protein  29.29 
 
 
368 aa  89.7  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  28.31 
 
 
394 aa  90.1  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  28.9 
 
 
381 aa  89.7  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1092  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  30.59 
 
 
430 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17260  selenocysteine lyase  32.09 
 
 
413 aa  89.7  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.118877  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.31 
 
 
407 aa  89.4  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1335  aminotransferase, class V  30.14 
 
 
413 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  28.81 
 
 
385 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  27.56 
 
 
430 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  27.08 
 
 
394 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  24.69 
 
 
394 aa  87.8  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2385  aminotransferase class V  32.02 
 
 
357 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00212379  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  28.53 
 
 
403 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  27.35 
 
 
401 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1472  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  29.01 
 
 
401 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  35.84 
 
 
414 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0469  aminotransferase, class V  28.12 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.14848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  24.37 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  25 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.4 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.36 
 
 
441 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.27 
 
 
418 aa  84  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.84 
 
 
442 aa  84  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.39 
 
 
432 aa  83.6  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  27.27 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.81 
 
 
417 aa  83.2  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.21 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>