More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3452 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3452  aminotransferase, class V  100 
 
 		 381 aa  790    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.237823  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  61.2 
 
 		 374 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  60.27 
 
 		 373 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  61.2 
 
 		 374 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  61.58 
 
 		 378 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  60.56 
 
 		 373 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  58.54 
 
 		 371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0304  aminotransferase class V  58.2 
 
 		 373 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0309  aminotransferase class V  58.47 
 
 		 373 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0300  aminotransferase class V  58.47 
 
 		 373 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0305  aminotransferase class V  58.2 
 
 		 373 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  57.26 
 
 		 371 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746937 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  55.19 
 
 		 370 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0411  aminotransferase, class V  37.69 
 
 		 357 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  27.16 
 
 		 384 aa  127  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  24.52 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4022  aminotransferase class V  25.88 
 
 		 372 aa  123  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0484  aminotransferase class V  27.2 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  24.43 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  26.5 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  28.88 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7639  kynureninase  27.12 
 
 		 409 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1534  kynureninase  26.44 
 
 		 393 aa  99.4  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.213107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00758  kynureninase  27.68 
 
 		 423 aa  98.2  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0563676  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1473  kynureninase  24.93 
 
 		 409 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3511  kynureninase  24.74 
 
 		 427 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  23.3 
 
 		 381 aa  96.7  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  22.37 
 
 		 379 aa  96.3  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3019  kynureninase  24.6 
 
 		 425 aa  94.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2085  kynureninase  23.76 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.867817  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3589  kynureninase  25.51 
 
 		 453 aa  94.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0759  hydrolase protein  25.69 
 
 		 417 aa  93.6  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1518  kynureninase  25.19 
 
 		 420 aa  92.8  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0681881  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0719  kynureninase  26.38 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.76256  normal  0.281792 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1389  kynureninase  24.68 
 
 		 413 aa  92  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0130616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9107  kynureninase  24.81 
 
 		 407 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1471  kynureninase  24.92 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0396616  normal  0.0356277 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0242  kynureninase  24.8 
 
 		 396 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0507  kynureninase  24.09 
 
 		 416 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0151824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0734  kynureninase  23.85 
 
 		 416 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  22.01 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1448  kynureninase  24.94 
 
 		 425 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83502  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  28.57 
 
 		 367 aa  90.1  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0709  kynureninase  25 
 
 		 417 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.540456  normal  0.132012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1230  kynureninase  24.68 
 
 		 393 aa  90.1  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0974944 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0099  kynureninase  25.16 
 
 		 416 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0352  kynureninase, putative  25.16 
 
 		 416 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.543237  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2486  kynureninase  25.16 
 
 		 416 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0651  kynureninase  25.16 
 
 		 416 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.131802  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1885  kynureninase  24.52 
 
 		 427 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0775  kynureninase  25.27 
 
 		 417 aa  89.7  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2523  kynureninase  24.04 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000799329  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2602  kynureninase  26.06 
 
 		 418 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1967  kynureninase  26.06 
 
 		 418 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2761  kynureninase  24.04 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000186702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2626  kynureninase  25.72 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2578  kynureninase  26.06 
 
 		 418 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.649182  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0893  kynureninase  25.16 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  23.16 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1054  kynureninase  25.16 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0896  kynureninase  25.16 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6512  kynureninase  25.07 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2497  kynureninase  25.72 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.651765  normal  0.855444 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2118  kynureninase  24.23 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.489178 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5245  kynureninase  23.39 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.668711 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2488  kynureninase  23.79 
 
 		 428 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.819206  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2559  kynureninase  22.76 
 
 		 428 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0488118  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5909  kynureninase  26.06 
 
 		 417 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  28.76 
 
 		 374 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2567  kynureninase  23.27 
 
 		 428 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2753  kynureninase  23.27 
 
 		 428 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.385452  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  23.24 
 
 		 379 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3228  kynureninase  23.27 
 
 		 416 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2526  kynureninase  23.26 
 
 		 428 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3208  kynureninase  25.46 
 
 		 416 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2650  kynureninase  25.15 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  23.76 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0710  kynureninase  25.16 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0491742  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5192  kynureninase  24.29 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2787  kynureninase  23 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00906384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  25.15 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37610  kynureninase  26.23 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2921  kynureninase  23.79 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2100  kynureninase  22.55 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2766  kynureninase  22.66 
 
 		 428 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2225  kynureninase  21.75 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.810346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1584  kynureninase  23.9 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.669783 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2620  kynureninase  21.7 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2808  kynureninase  22.22 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212385  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3072  aminotransferase class V  26.3 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237704  decreased coverage  0.0000000313902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0808  kynureninase  24 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4470  kynureninase  24.79 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479013 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1903  kynureninase  22.14 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.880029  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  26.67 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  25.06 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2439  kynureninase  22.99 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0679  kynureninase  22.34 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3396  kynureninase  23.94 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1437  aminotransferase class V  23.96 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000186875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4630  kynureninase  24.33 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0472348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>