More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3556 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  100 
 
 		 370 aa  758    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  63.74 
 
 		 373 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  63.56 
 
 		 374 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  63.56 
 
 		 374 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  62.84 
 
 		 378 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0305  aminotransferase class V  60.55 
 
 		 373 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0309  aminotransferase class V  60.82 
 
 		 373 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0304  aminotransferase class V  60.55 
 
 		 373 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  58.36 
 
 		 373 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0300  aminotransferase class V  60.82 
 
 		 373 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  59.34 
 
 		 371 aa  462  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  58.08 
 
 		 371 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3452  aminotransferase, class V  55.19 
 
 		 381 aa  427  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.237823  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0411  aminotransferase, class V  36.31 
 
 		 357 aa  249  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  27.2 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  26.92 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  30 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4022  aminotransferase class V  26.42 
 
 		 372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0484  aminotransferase class V  29.87 
 
 		 384 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  25.25 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  26.8 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  26.2 
 
 		 379 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  25.2 
 
 		 376 aa  96.7  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  25.95 
 
 		 368 aa  96.3  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1389  kynureninase  24.47 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0130616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1534  kynureninase  26.68 
 
 		 393 aa  93.6  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.213107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1471  kynureninase  27.56 
 
 		 409 aa  93.2  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0396616  normal  0.0356277 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  32.02 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  27.3 
 
 		 381 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7639  kynureninase  25.43 
 
 		 409 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37610  kynureninase  26.69 
 
 		 416 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  26.7 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0822  kynureninase  26.46 
 
 		 416 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.632925  hitchhiker  0.00000920194 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4470  kynureninase  25.49 
 
 		 416 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479013 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5192  kynureninase  24.91 
 
 		 409 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491737 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1473  kynureninase  25.36 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  26.39 
 
 		 379 aa  86.7  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1967  kynureninase  26.19 
 
 		 418 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2578  kynureninase  26.19 
 
 		 418 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.649182  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2602  kynureninase  26.19 
 
 		 418 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3208  kynureninase  26.12 
 
 		 416 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  27.86 
 
 		 352 aa  85.9  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  27.96 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3019  kynureninase  24.73 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3072  aminotransferase class V  26.65 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237704  decreased coverage  0.0000000313902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2225  kynureninase  23.16 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.810346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0679  kynureninase  26.09 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0507  kynureninase  27.08 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0151824 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5245  kynureninase  26.22 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.668711 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03589  aminotransferase, class V superfamily  26.82 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.301675  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3228  kynureninase  27.24 
 
 		 416 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0734  kynureninase  27.64 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2100  kynureninase  24.41 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2626  kynureninase  26.19 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  23.02 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3511  kynureninase  24.58 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  28.57 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2497  kynureninase  26.19 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.651765  normal  0.855444 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2118  kynureninase  25.85 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.489178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3589  kynureninase  24.48 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6512  kynureninase  26.02 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  26.35 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  27.65 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5909  kynureninase  25.6 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0719  kynureninase  25.89 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.76256  normal  0.281792 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2085  kynureninase  24.34 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.867817  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  25.96 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  27.59 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  31.17 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3396  kynureninase  23.91 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0709  kynureninase  26.16 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.540456  normal  0.132012 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  24.47 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  26.97 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  22.34 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  26.58 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0775  kynureninase  25.5 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0808  kynureninase  23.94 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0710  kynureninase  24.24 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0491742  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1448  kynureninase  25.56 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83502  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0352  kynureninase, putative  26.36 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.543237  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  25.09 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  26.24 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2486  kynureninase  26.36 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0651  kynureninase  26.36 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.131802  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0099  kynureninase  26.36 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0893  kynureninase  26.36 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0759  hydrolase protein  23.93 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9107  kynureninase  25.83 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1054  kynureninase  26.36 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2025  aminotransferase class V  25.63 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2921  kynureninase  23.01 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0896  kynureninase  26.36 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2385  aminotransferase class V  28.88 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00212379  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  26.87 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2650  kynureninase  23.22 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02408  Kynureninase  23.4 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1230  kynureninase  32.77 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0974944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  23.02 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2620  kynureninase  24.11 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  22.89 
 
 		 388 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>