238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3072 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3072  aminotransferase class V  100 
 
 		 357 aa  680    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237704  decreased coverage  0.0000000313902 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17260  selenocysteine lyase  45.35 
 
 		 413 aa  271  9e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.118877  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  46.78 
 
 		 352 aa  262  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  46.9 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2385  aminotransferase class V  47.66 
 
 		 357 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00212379  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0933  aminotransferase class V  50.15 
 
 		 351 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0028  hypothetical protein  47.46 
 
 		 368 aa  259  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0698  aminotransferase, class V  46.04 
 
 		 347 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0712  aminotransferase, class V  46.04 
 
 		 347 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0520963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  49.27 
 
 		 347 aa  256  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5841  aminotransferase class V  51.62 
 
 		 333 aa  249  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0692  aminotransferase, class V  46.63 
 
 		 347 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0756141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1799  aminotransferase, class V  48.09 
 
 		 347 aa  226  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  41.45 
 
 		 341 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1463  aminotransferase class V  43.1 
 
 		 352 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  41.87 
 
 		 345 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14510  hypothetical protein  49.8 
 
 		 334 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  27.81 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  32.72 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  28.36 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  23.92 
 
 		 373 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  26.12 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  32.31 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  28.1 
 
 		 374 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  28.1 
 
 		 374 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  29.2 
 
 		 378 aa  96.3  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  29.63 
 
 		 381 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  27.17 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0309  aminotransferase class V  27.21 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  28.73 
 
 		 384 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  28.98 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0304  aminotransferase class V  26.84 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0300  aminotransferase class V  26.84 
 
 		 373 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  26.65 
 
 		 370 aa  90.1  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0305  aminotransferase class V  26.84 
 
 		 373 aa  89.7  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  32.7 
 
 		 355 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  27.88 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3452  aminotransferase, class V  26.3 
 
 		 381 aa  86.7  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.237823  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  30.06 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  25.96 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  23.49 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  32.07 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  24.05 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  26.18 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  27.44 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  28.07 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  30.41 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  29.85 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  24.58 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13338  hypothetical isopenicillin N epimerase  21.97 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  27.52 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  27.08 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  30.89 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  31.09 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2025  aminotransferase class V  28.57 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  27.88 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  28.66 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  31.09 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  25.66 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  23.97 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2118  kynureninase  30.74 
 
 		 409 aa  69.3  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.489178 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  30.7 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  31.72 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2085  kynureninase  28.76 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.867817  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  27.61 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0411  aminotransferase, class V  23.79 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  28.19 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  30.7 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  26.33 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  30.7 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  25.62 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45663  predicted protein  23.77 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  26.3 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1308  aminotransferase class V  27.21 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1772  YheO domain protein  32.91 
 
 		 580 aa  63.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0242  kynureninase  31.95 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4630  kynureninase  31.06 
 
 		 421 aa  62.8  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0472348 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5192  kynureninase  27.4 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491737 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1885  kynureninase  31.54 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  28.25 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03589  aminotransferase, class V superfamily  30.92 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.301675  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5353  aminotransferase class V  32.87 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  26.93 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  25.25 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  22.49 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  24.76 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1584  kynureninase  31.95 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.669783 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  27.47 
 
 		 388 aa  59.3  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1230  kynureninase  30.77 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0974944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3511  kynureninase  32.89 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4022  aminotransferase class V  24.8 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  21.66 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  27.4 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  28.21 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1353  kynureninase  31.15 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6583  aminotransferase, class V  31.2 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  28 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4470  kynureninase  26.82 
 
 		 416 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479013 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  25.32 
 
 		 393 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  31.87 
 
 		 380 aa  57  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>