More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5353 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5353  aminotransferase class V  100 
 
 		 380 aa  739    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3773  aminotransferase class V  68.73 
 
 		 391 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  44.36 
 
 		 377 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  42.06 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7397  Selenocysteine lyase  39.57 
 
 		 382 aa  246  6.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  42.63 
 
 		 381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  39.5 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03589  aminotransferase, class V superfamily  36.44 
 
 		 393 aa  186  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.301675  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  27.53 
 
 		 380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  33 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  31.17 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  32.97 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  33.51 
 
 		 384 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  29.17 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  32.97 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  29.82 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  29.92 
 
 		 367 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45663  predicted protein  28.66 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  28.49 
 
 		 411 aa  109  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  29.43 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  29.57 
 
 		 401 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  27.94 
 
 		 377 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  29.4 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  26.4 
 
 		 377 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  30.68 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  25.27 
 
 		 368 aa  99.4  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  27.32 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  24.47 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  28.12 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  28.15 
 
 		 378 aa  94.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  28.65 
 
 		 382 aa  93.6  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  26.37 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  27.42 
 
 		 372 aa  90.9  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  29.24 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  28.53 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  27.72 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  25.81 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  27.51 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  26.16 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  28.99 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  26.74 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  23.61 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5190  aminotransferase class V  32.01 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  28.21 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  31.09 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  27.76 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  27.82 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  23.11 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  23.61 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0484  aminotransferase class V  27.2 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  24.44 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  27.62 
 
 		 896 aa  72.8  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  27.92 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2744  hypothetical protein  28.43 
 
 		 492 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5203  aminotransferase, class V  30 
 
 		 494 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00405553  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  26.57 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  24.88 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  26.97 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.56 
 
 		 885 aa  70.5  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  25.08 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  21.02 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4680  Cysteine desulfurase  27.72 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46473  normal  0.290444 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3365  aminotransferase class V  29.7 
 
 		 494 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  24.6 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  26.98 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  27.42 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  28.92 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  23.32 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  31.71 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0698  aminotransferase, class V  28.94 
 
 		 347 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0712  aminotransferase, class V  28.94 
 
 		 347 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0520963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  25.98 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  26.54 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  29.05 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  33.14 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  27.91 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4091  aminotransferase class V  29.48 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  25.45 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15700  cysteine desulfurase family protein  33.9 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  30.3 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  29.76 
 
 		 393 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4740  aminotransferase, class V  29.18 
 
 		 492 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3381  kynureninase  25.42 
 
 		 432 aa  67  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0702054 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3426  aminotransferase, class V  29.18 
 
 		 492 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1288  aminotransferase class V  35.48 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.322266  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  23.79 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  26.1 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4470  kynureninase  27.7 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479013 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  19.22 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2385  aminotransferase class V  28.98 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00212379  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  27.54 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  25.29 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1695  aminotransferase class V  29.18 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2002  aminotransferase class V  28.27 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.611456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1308  aminotransferase class V  22.46 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2118  kynureninase  29.71 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.489178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  25.58 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  24.68 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1473  kynureninase  28.45 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  25.06 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>