More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1864 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  100 
 
 		 352 aa  696    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2385  aminotransferase class V  52.99 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00212379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0028  hypothetical protein  52.66 
 
 		 368 aa  317  3e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  44.74 
 
 		 341 aa  269  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0933  aminotransferase class V  48.97 
 
 		 351 aa  265  5.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3072  aminotransferase class V  46.78 
 
 		 357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237704  decreased coverage  0.0000000313902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  45.09 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5841  aminotransferase class V  46.88 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  42.25 
 
 		 362 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0698  aminotransferase, class V  41.42 
 
 		 347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0712  aminotransferase, class V  41.42 
 
 		 347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0520963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1799  aminotransferase, class V  44.99 
 
 		 347 aa  232  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  42.39 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0692  aminotransferase, class V  41.72 
 
 		 347 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0756141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17260  selenocysteine lyase  36.24 
 
 		 413 aa  218  7.999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.118877  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1463  aminotransferase class V  38.33 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14510  hypothetical protein  47.93 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  29.89 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  33.15 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  29.17 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  32.88 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  26.83 
 
 		 371 aa  98.6  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  28.95 
 
 		 391 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  32.08 
 
 		 384 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  31.28 
 
 		 381 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  27.36 
 
 		 378 aa  93.6  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  28.8 
 
 		 377 aa  93.2  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  30.22 
 
 		 355 aa  92  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  24.86 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  25.6 
 
 		 387 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  28.33 
 
 		 399 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  30.62 
 
 		 389 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  27.86 
 
 		 370 aa  85.9  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  30.8 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  25.7 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  27.41 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  26.01 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  26.23 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  26.72 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  28.72 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  25.97 
 
 		 896 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  25.81 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  25.81 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  30.8 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  28.39 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  29.18 
 
 		 376 aa  79.3  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  25.18 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.31 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  25.98 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  23.95 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3773  aminotransferase class V  30.6 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  21.9 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  27.27 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  29.27 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  26.22 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.8 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1308  aminotransferase class V  27.53 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  24.52 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  25.71 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  26.35 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  27.15 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  25.81 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  28.09 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  27.72 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  24.75 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  23.8 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  21.65 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0489  probable cysteine desulfurase  21.56 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  30.75 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  24.74 
 
 		 393 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  29.12 
 
 		 380 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.13 
 
 		 415 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.58 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  21.59 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  22.77 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  29.06 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  27.7 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  28.42 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  28.52 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5353  aminotransferase class V  27.96 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  26.39 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.48 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.87 
 
 		 428 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.68 
 
 		 414 aa  69.3  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.04 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  26.3 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  24.48 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4022  aminotransferase class V  25.68 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  24.91 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  28.77 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  30.43 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  24.02 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3452  aminotransferase, class V  23.1 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.237823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  28.28 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  22.77 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  22.77 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  22.77 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  23.58 
 
 		 414 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  22.77 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  22.77 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>