121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0698 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0698  aminotransferase, class V  100 
 
 		 347 aa  683    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0712  aminotransferase, class V  100 
 
 		 347 aa  683    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0520963 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0692  aminotransferase, class V  99.42 
 
 		 347 aa  679    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0756141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5841  aminotransferase class V  49.42 
 
 		 333 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3072  aminotransferase class V  46.04 
 
 		 357 aa  250  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237704  decreased coverage  0.0000000313902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  45.43 
 
 		 362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  41.42 
 
 		 352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  45.81 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0933  aminotransferase class V  43.99 
 
 		 351 aa  226  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14510  hypothetical protein  49.8 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1799  aminotransferase, class V  46.41 
 
 		 347 aa  219  7.999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  41.39 
 
 		 341 aa  215  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2385  aminotransferase class V  39.88 
 
 		 357 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00212379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0028  hypothetical protein  41.67 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1463  aminotransferase class V  41.45 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17260  selenocysteine lyase  35.55 
 
 		 413 aa  186  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.118877  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  38.41 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  29.87 
 
 		 378 aa  89.7  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  29.01 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  29.66 
 
 		 381 aa  86.3  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  26.14 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  31.43 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  26.95 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  25.77 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  23.85 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  28.53 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  22.78 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  27.39 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0300  aminotransferase class V  26.42 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  26.94 
 
 		 372 aa  67  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0305  aminotransferase class V  26.02 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0309  aminotransferase class V  26.02 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0304  aminotransferase class V  25.61 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  27.22 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  26.59 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  30.77 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3773  aminotransferase class V  29.18 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  24.4 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  29.5 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  29.47 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  30.24 
 
 		 371 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746937 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  27.07 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  30.06 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  27.98 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5353  aminotransferase class V  28.04 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  26.56 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  27.03 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  26.51 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  29.18 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  24.45 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  26.87 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  26.52 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  29.49 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  26.42 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  28.73 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13338  hypothetical isopenicillin N epimerase  23.81 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  25.76 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  26.64 
 
 		 373 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  26.18 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  26.12 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  25.33 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4022  aminotransferase class V  26.75 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3452  aminotransferase, class V  25 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.237823  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  20.35 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  26.22 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  26.46 
 
 		 388 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  26.83 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  25 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2218  aminotransferase class V  29.82 
 
 		 426 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245886  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  19.73 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  25.99 
 
 		 378 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  23.27 
 
 		 387 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0246  aminotransferase, class V  35.43 
 
 		 381 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.189585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  25.27 
 
 		 394 aa  53.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  24.31 
 
 		 407 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  24.3 
 
 		 380 aa  52.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  24.84 
 
 		 384 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  23.85 
 
 		 416 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1683  hypothetical protein  30.17 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0813742  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  22.32 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  24.49 
 
 		 388 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0328  class-V aminotransferase  31.95 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  25.82 
 
 		 400 aa  50.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  26.57 
 
 		 393 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  25.82 
 
 		 402 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  28.41 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  24.79 
 
 		 399 aa  49.7  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  27.71 
 
 		 401 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  25.95 
 
 		 377 aa  49.7  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  26.55 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  31.84 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  23.46 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1473  kynureninase  28.29 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1308  aminotransferase class V  24.19 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  25.63 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  30 
 
 		 380 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9107  kynureninase  30.37 
 
 		 407 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  29.36 
 
 		 287 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6583  aminotransferase, class V  29.12 
 
 		 425 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  25.51 
 
 		 404 aa  47  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>