More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45663 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45663  predicted protein  100 
 
 		 356 aa  740    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  32.53 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  34.35 
 
 		 377 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  32.37 
 
 		 381 aa  126  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  31.77 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  27.69 
 
 		 398 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  28.1 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3773  aminotransferase class V  28.86 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5353  aminotransferase class V  27.25 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03589  aminotransferase, class V superfamily  24.34 
 
 		 393 aa  99.4  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.301675  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7397  Selenocysteine lyase  25.44 
 
 		 382 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  26.94 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  25.7 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  23.78 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  26.38 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  25.34 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  23.66 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  26.89 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  22.48 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  24.19 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  23.95 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  23.64 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  24.22 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  23.42 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  23.4 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  27.19 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  22.87 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  22.06 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  23.6 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  26.36 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  24.62 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  21.52 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  23.88 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  24.09 
 
 		 387 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  27.37 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  25.53 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  25.28 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  21.89 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  24.64 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0246  aminotransferase, class V  30 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.189585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  24.03 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  22.46 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0933  aminotransferase class V  25.86 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  21.3 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.47 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  27.35 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  28.87 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  25.59 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  24.14 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  26.5 
 
 		 386 aa  59.3  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  22.48 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04121  putative L-cysteine/cystine lyase  24.21 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0272358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.34 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0411  aminotransferase, class V  35.63 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2385  aminotransferase class V  26.45 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00212379  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  23.48 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  24.91 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  23.77 
 
 		 416 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  24.11 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  21.79 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  34.74 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  27.61 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.21 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0280  cysteine desulfurase family protein  25.64 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.59 
 
 		 443 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  23.63 
 
 		 422 aa  55.5  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  26.94 
 
 		 388 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  24.09 
 
 		 393 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  24.6 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1463  aminotransferase class V  25.54 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  24.55 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  24.9 
 
 		 403 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  23.05 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  27.89 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  26.37 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  21.61 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  23.56 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  24.18 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  23.98 
 
 		 393 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.38 
 
 		 429 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1710  hypothetical protein  27.96 
 
 		 387 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  22.7 
 
 		 395 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  24.55 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3999  cysteine desulfurase IscS  26.41 
 
 		 406 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102036  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  23.81 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3146  cysteine desulfurase  25.26 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0347283  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  21.99 
 
 		 393 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  23.26 
 
 		 404 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.48 
 
 		 421 aa  53.5  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  38.81 
 
 		 400 aa  53.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  26.37 
 
 		 404 aa  53.5  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.26 
 
 		 449 aa  53.5  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.05 
 
 		 421 aa  53.1  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  24.48 
 
 		 389 aa  53.5  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  20.34 
 
 		 390 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  25.82 
 
 		 404 aa  53.1  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  28.79 
 
 		 385 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.21 
 
 		 410 aa  53.1  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0041  aminotransferase class V  24.23 
 
 		 389 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.34 
 
 		 451 aa  53.1  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>