More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4268 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  100 
 
 
430 aa  870    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  75.18 
 
 
413 aa  602  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  56.22 
 
 
394 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  50.13 
 
 
399 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  45.01 
 
 
391 aa  361  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  42.89 
 
 
401 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  41.54 
 
 
407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  44.76 
 
 
393 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  41.98 
 
 
388 aa  282  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  44.62 
 
 
391 aa  280  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  40.62 
 
 
393 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  40.46 
 
 
403 aa  269  7e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  40.98 
 
 
395 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  37.34 
 
 
393 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  33.67 
 
 
395 aa  227  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  36.87 
 
 
395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  32.32 
 
 
413 aa  213  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1257  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  34.1 
 
 
403 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  31.68 
 
 
393 aa  170  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1367  aminotransferase  33.95 
 
 
377 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.699195  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38946  predicted protein  29.57 
 
 
495 aa  153  7e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  31.65 
 
 
394 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  31.99 
 
 
394 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  30.38 
 
 
878 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4705  hypothetical protein  26.88 
 
 
415 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.396867  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  28.95 
 
 
404 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53750  hypothetical protein  26.88 
 
 
415 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000314396  normal  0.0111206 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  28.4 
 
 
879 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  25.7 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  28.64 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.78 
 
 
428 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  27.54 
 
 
393 aa  126  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  24.87 
 
 
394 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  30.1 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  25.13 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  30.17 
 
 
381 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  29.45 
 
 
380 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  27.18 
 
 
880 aa  121  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.21 
 
 
885 aa  121  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.03 
 
 
406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  28.17 
 
 
393 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  25.31 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  28.4 
 
 
429 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  27.89 
 
 
896 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  28.08 
 
 
421 aa  116  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.09 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  24.23 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  27.1 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  28.1 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  26.63 
 
 
420 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.6 
 
 
433 aa  112  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.86 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.27 
 
 
418 aa  111  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  27.07 
 
 
400 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.01 
 
 
414 aa  110  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  27.46 
 
 
496 aa  110  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  28.1 
 
 
426 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.52 
 
 
420 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0328  class-V aminotransferase  30.77 
 
 
409 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  27.47 
 
 
416 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.61 
 
 
411 aa  107  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  28.77 
 
 
380 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  30.77 
 
 
385 aa  107  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  23.72 
 
 
386 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  25.54 
 
 
392 aa  106  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4836  aminotransferase class V  28.72 
 
 
363 aa  106  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0889282  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.33 
 
 
413 aa  106  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.54 
 
 
419 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  30.54 
 
 
382 aa  106  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  23.72 
 
 
386 aa  106  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  29.2 
 
 
417 aa  106  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  28.37 
 
 
380 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  27.87 
 
 
415 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.55 
 
 
429 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.31 
 
 
410 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.7 
 
 
419 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  27.08 
 
 
414 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  22.52 
 
 
422 aa  105  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  30.18 
 
 
380 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0386  cysteine desulfurase, SufS family protein  31.56 
 
 
452 aa  104  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.559739 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  28.74 
 
 
385 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  24.73 
 
 
380 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  27.88 
 
 
387 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  27.69 
 
 
382 aa  104  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.91 
 
 
417 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.16 
 
 
414 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  25.6 
 
 
423 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  27.22 
 
 
377 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  26.76 
 
 
430 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.17 
 
 
404 aa  101  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  26.74 
 
 
379 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  27.34 
 
 
414 aa  101  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.81 
 
 
425 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.3 
 
 
444 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.7 
 
 
413 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  27.34 
 
 
414 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  26.67 
 
 
383 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.78 
 
 
420 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.75 
 
 
417 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.75 
 
 
417 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>