More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4955 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  100 
 
 		 387 aa  796    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  69.76 
 
 		 416 aa  548  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  64.88 
 
 		 382 aa  525  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  32.63 
 
 		 378 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  32.89 
 
 		 379 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  31.43 
 
 		 379 aa  166  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  33.55 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  27.89 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  28.8 
 
 		 376 aa  159  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  28.86 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  30.31 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  28.06 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  31.75 
 
 		 401 aa  136  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  25.61 
 
 		 368 aa  136  7.000000000000001e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  27.66 
 
 		 381 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  28.76 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  28.26 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  25.58 
 
 		 391 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  27.25 
 
 		 377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  28.23 
 
 		 367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  26.6 
 
 		 407 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  29.93 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  27.6 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  27.6 
 
 		 372 aa  124  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  27.84 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  26.12 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  26.18 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  30.53 
 
 		 377 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  25.94 
 
 		 879 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  28.23 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  27.64 
 
 		 393 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  28.84 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  30.03 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  26.56 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  27.37 
 
 		 380 aa  113  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  25 
 
 		 880 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  27.74 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  26.84 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  26.6 
 
 		 378 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  23.77 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  25.32 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  27.71 
 
 		 394 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  29.87 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  27.22 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  27.06 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  22.64 
 
 		 393 aa  106  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  26.27 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  26.8 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  25.24 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.63 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.67 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  26.69 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  27.83 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  27.88 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  25.85 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.75 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.63 
 
 		 406 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  25.98 
 
 		 381 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.84 
 
 		 885 aa  103  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  26.13 
 
 		 393 aa  103  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0484  aminotransferase class V  24.8 
 
 		 384 aa  102  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  24.47 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  24.47 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  24.47 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  27.94 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.96 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  26.32 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  26.2 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  24.23 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.46 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  26.17 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  23.93 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.99 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.13 
 
 		 406 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  24.69 
 
 		 381 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.99 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  24.47 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  28.31 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.94 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  29.1 
 
 		 396 aa  99.8  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  26.94 
 
 		 393 aa  99.4  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  28.84 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  25.27 
 
 		 384 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  24.92 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.97 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  23.99 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  23.99 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  25.3 
 
 		 423 aa  98.2  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.67 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.94 
 
 		 417 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  29.52 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  27.06 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.44 
 
 		 408 aa  98.2  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0462  cysteine desulfurase  25.85 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.49202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.99 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26810  cysteine desulfurase  26.19 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.55 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  25.56 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.43 
 
 		 407 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>