More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6148 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  100 
 
 		 416 aa  853    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  69.76 
 
 		 387 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  66.49 
 
 		 382 aa  509  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  33.86 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  31.77 
 
 		 387 aa  177  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  32.02 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  31.2 
 
 		 393 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  29.82 
 
 		 392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  28.03 
 
 		 376 aa  152  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  32.18 
 
 		 379 aa  145  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  30.74 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  30.67 
 
 		 377 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  29.11 
 
 		 394 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  28.61 
 
 		 367 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  26.99 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  29.87 
 
 		 372 aa  129  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  32.7 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  28.98 
 
 		 381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  31.56 
 
 		 377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  26.15 
 
 		 368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  29.4 
 
 		 393 aa  127  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  28.01 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.59 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  26.59 
 
 		 380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  30.27 
 
 		 408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  27.82 
 
 		 403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  28.46 
 
 		 372 aa  120  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  27.13 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  29.34 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  27.01 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  28.53 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  27.97 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  29.55 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  32.35 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  25.42 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  27.98 
 
 		 430 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  29.89 
 
 		 380 aa  116  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  24.87 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.52 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  26.67 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  29.28 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.57 
 
 		 407 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  28.9 
 
 		 393 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  26.63 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  26.7 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  26.83 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  29.95 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.08 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  24.87 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  26.08 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  24.81 
 
 		 381 aa  111  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  29.59 
 
 		 383 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.46 
 
 		 421 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  28.32 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.52 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  29.5 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  26.92 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  27.39 
 
 		 394 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  26.54 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.63 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  23.82 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.24 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.55 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  25.88 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  28.2 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  25.25 
 
 		 880 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.3 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  26.04 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  27.41 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  27.27 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.34 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  26.83 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  25.63 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  24.94 
 
 		 879 aa  107  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  26.29 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  28.85 
 
 		 387 aa  106  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.59 
 
 		 406 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.59 
 
 		 406 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.55 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.78 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  28.32 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.59 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  27.84 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.8 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  25.13 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  24.5 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.59 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  25.82 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  24.75 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.55 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.18 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.18 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.18 
 
 		 885 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.6 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.37 
 
 		 420 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.55 
 
 		 406 aa  104  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.28 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  24.28 
 
 		 406 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  24.28 
 
 		 406 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  28.84 
 
 		 413 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>