More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0737 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  100 
 
 		 368 aa  750    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  55.46 
 
 		 376 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  35.79 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 379 aa  196  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  30.29 
 
 		 376 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  29.02 
 
 		 377 aa  179  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  32.32 
 
 		 411 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  29.3 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  29.51 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  31.22 
 
 		 378 aa  169  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  28.03 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  30.45 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  30.89 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  29.33 
 
 		 377 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  28.42 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  30.65 
 
 		 392 aa  156  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  28.53 
 
 		 401 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  29.19 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  29.97 
 
 		 393 aa  153  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  26.81 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  27.89 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  29.01 
 
 		 394 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  28.25 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  29.16 
 
 		 394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  27.72 
 
 		 401 aa  145  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  27.74 
 
 		 880 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  27.15 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  29.43 
 
 		 381 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  30.65 
 
 		 878 aa  139  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  33.56 
 
 		 287 aa  139  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  28.84 
 
 		 393 aa  139  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.71 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  25.61 
 
 		 387 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  29.95 
 
 		 896 aa  135  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  26.86 
 
 		 391 aa  135  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  28.28 
 
 		 879 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.25 
 
 		 885 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  27.27 
 
 		 380 aa  133  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  28.2 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  28.57 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  28.87 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  31.79 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  28.72 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  28.94 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  26.7 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  28.39 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  28.61 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0484  aminotransferase class V  28.19 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  26.02 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  32.81 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  27.94 
 
 		 381 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  25.88 
 
 		 416 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  27.4 
 
 		 380 aa  122  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  28.9 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  27.37 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  29.38 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  26.62 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  27.81 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  25.73 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.05 
 
 		 413 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  22.67 
 
 		 399 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.05 
 
 		 413 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  29.09 
 
 		 380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  27.8 
 
 		 374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  26.33 
 
 		 393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  27.8 
 
 		 374 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  26.65 
 
 		 380 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  26.67 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  24.06 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  28.28 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  29.43 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  24.18 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  25.81 
 
 		 390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  25.88 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  33.08 
 
 		 385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  26.88 
 
 		 416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  22.96 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  24.81 
 
 		 415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.75 
 
 		 410 aa  116  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  26.88 
 
 		 416 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  28.99 
 
 		 420 aa  116  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.65 
 
 		 418 aa  116  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  33.65 
 
 		 380 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  28.02 
 
 		 383 aa  116  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  26.6 
 
 		 373 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  30.74 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  22.94 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  24.68 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  25.19 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  26.68 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  27.51 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  26.82 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  28.53 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  26.89 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  31.66 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  25.52 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  27.3 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  25.65 
 
 		 417 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.05 
 
 		 433 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  26.29 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>