More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8515 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  100 
 
 		 401 aa  816    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  64.77 
 
 		 407 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  61.92 
 
 		 393 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  53.81 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  51.03 
 
 		 391 aa  350  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  51.56 
 
 		 395 aa  349  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  42.86 
 
 		 395 aa  338  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  45.26 
 
 		 403 aa  333  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  44.16 
 
 		 393 aa  323  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  41.18 
 
 		 391 aa  307  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  42.89 
 
 		 430 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  43.44 
 
 		 388 aa  305  8.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  42.6 
 
 		 394 aa  296  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  43.92 
 
 		 395 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1257  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.45 
 
 		 403 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  40.56 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  41.22 
 
 		 413 aa  262  8.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  33.25 
 
 		 413 aa  239  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38946  predicted protein  34.01 
 
 		 495 aa  217  2.9999999999999998e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  34.34 
 
 		 394 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  33.67 
 
 		 393 aa  200  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  33.08 
 
 		 394 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1367  aminotransferase  34.42 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.699195  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  30.36 
 
 		 394 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  27.25 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  31.11 
 
 		 880 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4705  hypothetical protein  29.26 
 
 		 415 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.396867  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  27.18 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53750  hypothetical protein  29.26 
 
 		 415 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000314396  normal  0.0111206 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  32.56 
 
 		 878 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.45 
 
 		 420 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  26.3 
 
 		 408 aa  150  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.99 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.72 
 
 		 885 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.26 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  28.97 
 
 		 393 aa  146  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  26.68 
 
 		 420 aa  146  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.2 
 
 		 412 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  28.54 
 
 		 626 aa  146  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  32.22 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.12 
 
 		 608 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  28.24 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.89 
 
 		 444 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.7 
 
 		 414 aa  143  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  27.55 
 
 		 423 aa  143  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  30.35 
 
 		 429 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  28.18 
 
 		 401 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.86 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  28.61 
 
 		 896 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  26.6 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.23 
 
 		 414 aa  140  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  27.99 
 
 		 408 aa  139  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.74 
 
 		 409 aa  138  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  30.05 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  27.02 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  26.77 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.7 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.74 
 
 		 673 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.26 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.27 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  29.26 
 
 		 879 aa  138  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.48 
 
 		 678 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  25.56 
 
 		 425 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.79 
 
 		 441 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.03 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.64 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.78 
 
 		 419 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  26.96 
 
 		 420 aa  137  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  28.24 
 
 		 387 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.54 
 
 		 419 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.62 
 
 		 415 aa  135  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.37 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.59 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.07 
 
 		 644 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  27.53 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.87 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.71 
 
 		 425 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.27 
 
 		 605 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  28.29 
 
 		 421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.76 
 
 		 650 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.87 
 
 		 672 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  28.4 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.23 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  29.17 
 
 		 604 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.76 
 
 		 666 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  29.17 
 
 		 604 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.87 
 
 		 674 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  26.62 
 
 		 414 aa  133  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.99 
 
 		 451 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  27.32 
 
 		 688 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.1 
 
 		 414 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  27.48 
 
 		 682 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  27.52 
 
 		 666 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.48 
 
 		 415 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  27.41 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.29 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  26.85 
 
 		 367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.29 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  27.53 
 
 		 393 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.05 
 
 		 417 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>