More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4459 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  100 
 
 		 341 aa  677    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  56.65 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1799  aminotransferase, class V  60.69 
 
 		 347 aa  349  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  51.59 
 
 		 362 aa  322  7e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2385  aminotransferase class V  50.73 
 
 		 357 aa  295  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00212379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  47.46 
 
 		 345 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  44.74 
 
 		 352 aa  269  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0028  hypothetical protein  47.11 
 
 		 368 aa  249  6e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1463  aminotransferase class V  45.75 
 
 		 352 aa  249  7e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0698  aminotransferase, class V  41.39 
 
 		 347 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0712  aminotransferase, class V  41.39 
 
 		 347 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0520963 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3072  aminotransferase class V  41.45 
 
 		 357 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237704  decreased coverage  0.0000000313902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5841  aminotransferase class V  43.98 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0933  aminotransferase class V  44.18 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0692  aminotransferase, class V  41.69 
 
 		 347 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0756141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17260  selenocysteine lyase  34.51 
 
 		 413 aa  180  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.118877  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14510  hypothetical protein  45.34 
 
 		 334 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  29.25 
 
 		 376 aa  106  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  30.71 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  30.43 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  30.25 
 
 		 384 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  30.08 
 
 		 389 aa  99.4  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  28.23 
 
 		 381 aa  98.6  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  29.91 
 
 		 381 aa  96.3  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  28.61 
 
 		 377 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  27.6 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  29.5 
 
 		 379 aa  94  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  27.7 
 
 		 367 aa  92.8  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  27.42 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  28.85 
 
 		 372 aa  90.5  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  26.38 
 
 		 378 aa  90.5  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  28.77 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  26.76 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  29.86 
 
 		 401 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  26.43 
 
 		 371 aa  85.9  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746937 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  28.62 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3452  aminotransferase, class V  25.15 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.237823  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  25.95 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  28.33 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  28.32 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  26.2 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  25.07 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.63 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  28.47 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  22.74 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  26.58 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  26.32 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  26.42 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  25.15 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  25.63 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  23.04 
 
 		 430 aa  72.8  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  26.62 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2091  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.63 
 
 		 419 aa  72.8  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000201738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.45 
 
 		 412 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  25.85 
 
 		 896 aa  72  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.75 
 
 		 662 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  23.6 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1308  aminotransferase class V  26.61 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.76 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.67 
 
 		 657 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  25.21 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  25.07 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  21.95 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  23.99 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  28.11 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  24.79 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  26.6 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.76 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0309  aminotransferase class V  24.31 
 
 		 373 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  24.32 
 
 		 402 aa  67  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  27.27 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.32 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  22.41 
 
 		 885 aa  66.6  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  25.17 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.64 
 
 		 406 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0304  aminotransferase class V  23.76 
 
 		 373 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  23.59 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  24.7 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.64 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  21.16 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  25 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0300  aminotransferase class V  24.31 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.67 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0305  aminotransferase class V  24.03 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4022  aminotransferase class V  26.5 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.66 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  26.48 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  22.54 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  21.7 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  23.38 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  25.41 
 
 		 496 aa  65.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  22.36 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.8 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  25.86 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  21.85 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  24.49 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  22.54 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  22.54 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.54 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.21 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>