More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4796 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  100 
 
 		 362 aa  709    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  54.99 
 
 		 347 aa  342  5e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  51.59 
 
 		 341 aa  322  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1799  aminotransferase, class V  54.7 
 
 		 347 aa  312  5.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2385  aminotransferase class V  46 
 
 		 357 aa  271  9e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00212379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0028  hypothetical protein  47.46 
 
 		 368 aa  255  9e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  45.75 
 
 		 345 aa  252  7e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1463  aminotransferase class V  46.71 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3072  aminotransferase class V  46.9 
 
 		 357 aa  249  5e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237704  decreased coverage  0.0000000313902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0698  aminotransferase, class V  45.43 
 
 		 347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0712  aminotransferase, class V  45.43 
 
 		 347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0520963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  42.25 
 
 		 352 aa  240  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0692  aminotransferase, class V  45.13 
 
 		 347 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0756141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0933  aminotransferase class V  45.83 
 
 		 351 aa  232  6e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5841  aminotransferase class V  46.33 
 
 		 333 aa  222  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17260  selenocysteine lyase  38.78 
 
 		 413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.118877  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14510  hypothetical protein  43.57 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  32.79 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  31 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  33.06 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  32.79 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  29.44 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  32.62 
 
 		 381 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  30.81 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  28.85 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  28.53 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  29.04 
 
 		 381 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  29.56 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  29.65 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  28.49 
 
 		 376 aa  93.6  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  26.67 
 
 		 384 aa  93.2  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  29.25 
 
 		 372 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  28.65 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  26.83 
 
 		 373 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  26.49 
 
 		 374 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  27.6 
 
 		 378 aa  86.3  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  26.22 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  30.09 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  28.83 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  24.09 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  24.66 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  26.97 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  26.73 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  27.21 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  30.87 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  28.61 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  25.07 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  30.26 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0309  aminotransferase class V  24.47 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0304  aminotransferase class V  24.47 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1308  aminotransferase class V  26.9 
 
 		 382 aa  79.3  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0305  aminotransferase class V  24.47 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  27.2 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  27.59 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0300  aminotransferase class V  24.2 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  31.02 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  25 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0280  cysteine desulfurase family protein  33.16 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155667  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  31.52 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  31.22 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  27.42 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746937 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1389  kynureninase  30.66 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0130616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  23.58 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  24.54 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  28.48 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  27.76 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  29.74 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  27.41 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  27.03 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  26.78 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  30.12 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  25 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  29.1 
 
 		 403 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  29.39 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  26.37 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  26.34 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  23.42 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  22.83 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4022  aminotransferase class V  28.94 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  30.23 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0489  probable cysteine desulfurase  22.7 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6583  aminotransferase, class V  37.58 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  28.75 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  27.83 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  26.16 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  23.67 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  32.02 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  29.55 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  28.06 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  26.7 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  26.23 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  25.38 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  24.48 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  26.13 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  29.39 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  30.81 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  33.48 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  26.19 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  21.76 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  26.65 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>