More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0933 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0933  aminotransferase class V  100 
 
 		 351 aa  684    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  48.97 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2385  aminotransferase class V  48.21 
 
 		 357 aa  276  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00212379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0028  hypothetical protein  51.04 
 
 		 368 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3072  aminotransferase class V  50.58 
 
 		 357 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237704  decreased coverage  0.0000000313902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  47.2 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  45.83 
 
 		 362 aa  246  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0698  aminotransferase, class V  44.57 
 
 		 347 aa  242  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0712  aminotransferase, class V  44.57 
 
 		 347 aa  242  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0520963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5841  aminotransferase class V  48.94 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17260  selenocysteine lyase  41.67 
 
 		 413 aa  238  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.118877  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0692  aminotransferase, class V  45.27 
 
 		 347 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0756141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  44.18 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1799  aminotransferase, class V  46.61 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1463  aminotransferase class V  43.47 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14510  hypothetical protein  48.76 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  42.64 
 
 		 345 aa  202  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  32.96 
 
 		 391 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  32.1 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  29.38 
 
 		 384 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  27.04 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  31.38 
 
 		 376 aa  92.8  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  23.7 
 
 		 376 aa  89.4  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  27.27 
 
 		 368 aa  87.8  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  31.93 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  31.6 
 
 		 411 aa  86.3  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  29.73 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  32.44 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  30.47 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  27.6 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  26.24 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  30.7 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  26.59 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  30.47 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  27.64 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  29.47 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  26.52 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  28.98 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  28.8 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  29.47 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  29.86 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  25.97 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  27.7 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  32.43 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  29.37 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  28.33 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  25.76 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  25.91 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  25.78 
 
 		 387 aa  72.8  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3452  aminotransferase, class V  24.01 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.237823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  28.06 
 
 		 384 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13338  hypothetical isopenicillin N epimerase  22.77 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  29.36 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  31.16 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0300  aminotransferase class V  26.26 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  27.98 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  25.56 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  27.95 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0305  aminotransferase class V  25.98 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  26.53 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0309  aminotransferase class V  25.76 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3773  aminotransferase class V  33.66 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  26.98 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  23.58 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0304  aminotransferase class V  25.48 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  31.6 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  25.41 
 
 		 378 aa  67  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  28.62 
 
 		 392 aa  67  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0484  aminotransferase class V  28.25 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  24.48 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  27.21 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  28.16 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0199  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.43 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  29.43 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03589  aminotransferase, class V superfamily  33.46 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.301675  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  26.5 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  31.74 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  29.74 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  28.84 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  26.61 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  29.07 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  26.8 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  28.57 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  27.73 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  34.16 
 
 		 395 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  27.82 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0328  class-V aminotransferase  31.96 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  28.7 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  29.39 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45663  predicted protein  25.68 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  30.77 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  27.7 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  23.34 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  29.29 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2018  MCP methyltransferase, CheR-type  25.44 
 
 		 865 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.854917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  32.44 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0669  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.77 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.700717  normal  0.366803 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  25.88 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  22.16 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>