More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3773 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3773  aminotransferase class V  100 
 
 		 391 aa  746    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5353  aminotransferase class V  68.73 
 
 		 380 aa  448  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  43.39 
 
 		 381 aa  256  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  44.24 
 
 		 381 aa  256  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7397  Selenocysteine lyase  41.44 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  42.89 
 
 		 377 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  39.72 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  32.72 
 
 		 398 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  28.16 
 
 		 380 aa  162  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03589  aminotransferase, class V superfamily  33.78 
 
 		 393 aa  160  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.301675  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45663  predicted protein  29.21 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  29.86 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  29.5 
 
 		 382 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  27.78 
 
 		 387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  29.86 
 
 		 381 aa  109  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  28.42 
 
 		 377 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  29.89 
 
 		 377 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  29.65 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  31.7 
 
 		 384 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  31.09 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  31.38 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  31.21 
 
 		 376 aa  102  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  27.98 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  30.52 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  26.87 
 
 		 377 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  28.85 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  29.04 
 
 		 411 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  28.68 
 
 		 379 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  27.25 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  28.02 
 
 		 391 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  28.14 
 
 		 367 aa  89.7  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  26.9 
 
 		 368 aa  89.4  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  26.67 
 
 		 437 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  26.82 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746937 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  32.28 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  27.65 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  30.21 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  26.23 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  24.38 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  24.61 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  27.07 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  26.22 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  27.07 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  27.16 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  28.3 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  32.29 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  29.79 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  27.27 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  19.69 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  24.55 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  27.65 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  26.99 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  26.99 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  26.9 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  26.99 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4470  kynureninase  30.56 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479013 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  26.57 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  28.83 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  27.02 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  25.43 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0698  aminotransferase, class V  30.96 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0712  aminotransferase, class V  30.96 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0520963 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  25.08 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  27.3 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  27.3 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  27.3 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  27.3 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  27.3 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  32.39 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  27.3 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  25.67 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  25.67 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  27.3 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  28.94 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  26.27 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  31.8 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  26.27 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1353  kynureninase  29.84 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  25.89 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  25.52 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  22.94 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  27.31 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  26.09 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0692  aminotransferase, class V  29.91 
 
 		 347 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0756141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  26.5 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  23.72 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  33.96 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  26.73 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4612  cysteine desulfurase  24.64 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0217102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3511  cysteine desulfurase  25.86 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  28.22 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4336  cysteine desulfurase  26.59 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.180367  hitchhiker  0.00000000219205 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  26 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0842  cysteine desulfurase  26.01 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0648359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0872  cysteine desulfurase  26.01 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0822  kynureninase  29.82 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.632925  hitchhiker  0.00000920194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0885  cysteine desulfurase  26.01 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306655  hitchhiker  0.00050858 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  26.73 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.4 
 
 		 885 aa  67.4  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  25.54 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>