141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13338 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_13338  hypothetical isopenicillin N epimerase  100 
 
 		 361 aa  741    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  25.07 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  25.91 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  26.42 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  24.53 
 
 		 376 aa  93.2  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  21.56 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  25.67 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  25.4 
 
 		 377 aa  86.3  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  23.78 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  23.14 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  24.08 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  20.86 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  24.26 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  21.66 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  21.11 
 
 		 367 aa  75.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  23.31 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  21.77 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  23.23 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  24.8 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  23.85 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3072  aminotransferase class V  21.41 
 
 		 357 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237704  decreased coverage  0.0000000313902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  20.16 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17260  selenocysteine lyase  21.37 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.118877  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  22.51 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  21.75 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  22.25 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  21.83 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  22.05 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  26.72 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  21.41 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  21.3 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  22.08 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  22.18 
 
 		 401 aa  62.8  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  23.31 
 
 		 438 aa  62.8  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  22.19 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  21.26 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  22.82 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  20.77 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  21.67 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  24.07 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  23.1 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  24.01 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  19.57 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  20.51 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2385  aminotransferase class V  21.95 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00212379  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0933  aminotransferase class V  25.23 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  21.99 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  25.52 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3538  aminotransferase class V  20.82 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  23.21 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  20.15 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0698  aminotransferase, class V  23.81 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0712  aminotransferase, class V  23.81 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0520963 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  22.97 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  20.96 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  21.25 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4214  aminotransferase, class V  21.97 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  23.21 
 
 		 469 aa  57  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  21.45 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  22.73 
 
 		 415 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  19.94 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  20.22 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  22.91 
 
 		 341 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  24.3 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  21.77 
 
 		 388 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0692  aminotransferase, class V  23.79 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0756141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  22.03 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0411  aminotransferase, class V  19.22 
 
 		 357 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  20.99 
 
 		 380 aa  53.9  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  21.72 
 
 		 387 aa  53.5  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  21.15 
 
 		 393 aa  53.1  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  19.88 
 
 		 426 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  20.98 
 
 		 352 aa  52.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6583  aminotransferase, class V  25.17 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  19.69 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61494  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  24.15 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0727802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  20.54 
 
 		 427 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3452  aminotransferase, class V  21.78 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.237823  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1412  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.28 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1642  aminotransferase, class V  19.48 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1458  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.28 
 
 		 413 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  22.98 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  19.84 
 
 		 392 aa  50.4  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  19.87 
 
 		 430 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  21.66 
 
 		 381 aa  49.7  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  21.37 
 
 		 462 aa  49.3  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  19.03 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  22.4 
 
 		 383 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  18.77 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  24.84 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1852  twin-arginine translocation pathway signal  19.83 
 
 		 431 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776832 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  22.01 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  19.75 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  21.07 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  22.95 
 
 		 460 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  24.45 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2018  MCP methyltransferase, CheR-type  20.31 
 
 		 865 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.854917  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  20.29 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  21.47 
 
 		 383 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  21.46 
 
 		 380 aa  47  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>