More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0407 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0305  aminotransferase class V  85.25 
 
 
373 aa  669    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0300  aminotransferase class V  85.25 
 
 
373 aa  671    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0304  aminotransferase class V  84.72 
 
 
373 aa  667    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  100 
 
 
373 aa  770    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0309  aminotransferase class V  84.99 
 
 
373 aa  669    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  76.94 
 
 
373 aa  619  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  77.01 
 
 
374 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  76.74 
 
 
374 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  75.66 
 
 
378 aa  599  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  67.39 
 
 
371 aa  530  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  58.36 
 
 
370 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3452  aminotransferase, class V  60.56 
 
 
381 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.237823  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  58.38 
 
 
371 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.746937 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0411  aminotransferase, class V  37.61 
 
 
357 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  27.2 
 
 
379 aa  155  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4022  aminotransferase class V  29.41 
 
 
372 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  26.19 
 
 
384 aa  126  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0484  aminotransferase class V  26.83 
 
 
384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  25.2 
 
 
391 aa  113  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  26.48 
 
 
368 aa  109  9.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  24.93 
 
 
381 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1534  kynureninase  26.18 
 
 
393 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.213107  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  25.71 
 
 
376 aa  103  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1473  kynureninase  26.87 
 
 
409 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1471  kynureninase  25.7 
 
 
409 aa  102  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0396616  normal  0.0356277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0709  kynureninase  24.2 
 
 
417 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.540456  normal  0.132012 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  29.55 
 
 
367 aa  100  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7639  kynureninase  26.3 
 
 
409 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3511  kynureninase  28.17 
 
 
427 aa  99.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  24.63 
 
 
379 aa  98.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  24.46 
 
 
381 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37610  kynureninase  25.41 
 
 
416 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88589  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0775  kynureninase  23.94 
 
 
417 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2650  kynureninase  24.22 
 
 
418 aa  96.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3208  kynureninase  25.63 
 
 
416 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5192  kynureninase  24.77 
 
 
409 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.491737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3396  kynureninase  29.17 
 
 
413 aa  94.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2225  kynureninase  22.25 
 
 
396 aa  92.8  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.810346  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0759  hydrolase protein  25.67 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2118  kynureninase  24.13 
 
 
409 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.489178 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2085  kynureninase  23.17 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.867817  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0808  kynureninase  23.56 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  27.4 
 
 
381 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2164  kynureninase  24.68 
 
 
434 aa  90.5  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0484937  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3589  kynureninase  24.77 
 
 
453 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2921  kynureninase  22.01 
 
 
414 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1147  kynureninase  24.71 
 
 
421 aa  90.1  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000995663  normal  0.0175676 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  22.89 
 
 
379 aa  90.1  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3072  aminotransferase class V  23.92 
 
 
357 aa  90.1  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237704  decreased coverage  0.0000000313902 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02408  Kynureninase  25.22 
 
 
411 aa  89.7  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1389  kynureninase  24.12 
 
 
413 aa  89.7  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0130616  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0822  kynureninase  24.35 
 
 
416 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.632925  hitchhiker  0.00000920194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6512  kynureninase  26.57 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4470  kynureninase  25 
 
 
416 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479013 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2598  kynureninase  28.32 
 
 
424 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.454371  normal  0.319557 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0680  kynureninase  23.84 
 
 
424 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  27.18 
 
 
404 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  25.67 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  24.75 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  24.66 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  28.74 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2523  kynureninase  23.6 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000799329  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5245  kynureninase  25.82 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.668711 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2787  kynureninase  24.12 
 
 
428 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00906384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2761  kynureninase  23.6 
 
 
428 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000186702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9107  kynureninase  26.26 
 
 
407 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2766  kynureninase  23.62 
 
 
428 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2808  kynureninase  23.23 
 
 
428 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2488  kynureninase  23.35 
 
 
428 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.819206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1518  kynureninase  23.3 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0681881  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1903  kynureninase  22.89 
 
 
428 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.880029  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  29.22 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  23.73 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2567  kynureninase  23.6 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2753  kynureninase  23.6 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.385452  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3228  kynureninase  22.79 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  25 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  23.23 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  26.25 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  27.53 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2559  kynureninase  22.96 
 
 
428 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0488118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  23.23 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  23.73 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2100  kynureninase  20.83 
 
 
422 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0922  kynureninase  30.62 
 
 
413 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.50677  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2439  kynureninase  28.64 
 
 
437 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2602  kynureninase  22.92 
 
 
418 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1967  kynureninase  22.92 
 
 
418 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2578  kynureninase  22.92 
 
 
418 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.649182  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0719  kynureninase  22.64 
 
 
418 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.76256  normal  0.281792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1353  kynureninase  24.79 
 
 
423 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  25.18 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  27.6 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0507  kynureninase  22.97 
 
 
416 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0151824 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02180  Kynureninase  23.76 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.641919  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2497  kynureninase  23.21 
 
 
417 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.651765  normal  0.855444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  23.81 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0734  kynureninase  21.79 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03589  aminotransferase, class V superfamily  27.88 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.301675  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0710  kynureninase  22.63 
 
 
416 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0491742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>