212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6583 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6583  aminotransferase, class V  100 
 
 		 425 aa  825    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1772  YheO domain protein  39.23 
 
 		 580 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  27.23 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  30.23 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  26.69 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  27.1 
 
 		 379 aa  99.8  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  27.88 
 
 		 411 aa  90.5  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  23.6 
 
 		 377 aa  90.1  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  29.48 
 
 		 376 aa  90.1  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  27.79 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  27.4 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  25.12 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  27.44 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  28.03 
 
 		 376 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  25.71 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  26.69 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  37.06 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  32.29 
 
 		 372 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  27.47 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  25.88 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  28.57 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  24.79 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1308  aminotransferase class V  26.18 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  25.07 
 
 		 377 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  21.62 
 
 		 380 aa  67  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  27.16 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  30.77 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5192  kynureninase  31.79 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491737 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  27.16 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  31.25 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  24.76 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1473  kynureninase  30.73 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  32.63 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1463  aminotransferase class V  35.82 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  29.26 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17260  selenocysteine lyase  29.8 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.118877  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4470  kynureninase  33.67 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479013 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  24.93 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3072  aminotransferase class V  32.7 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237704  decreased coverage  0.0000000313902 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  28.64 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  22.34 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  24.45 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  26.52 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  28.64 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0411  aminotransferase, class V  23.29 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5841  aminotransferase class V  31.3 
 
 		 333 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  26.83 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  26.75 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1471  kynureninase  31.96 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0396616  normal  0.0356277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  26.3 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7639  kynureninase  29.69 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  27.46 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2118  kynureninase  30.15 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.489178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1389  kynureninase  27.76 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0130616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  30.54 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  28.72 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.47 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  22.94 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  27.1 
 
 		 345 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13338  hypothetical isopenicillin N epimerase  20.82 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  36.84 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  30.77 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  22.54 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  31.84 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  28.68 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4630  kynureninase  29.48 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0472348 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  24.46 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2085  kynureninase  29.06 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.867817  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0822  kynureninase  29.55 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.632925  hitchhiker  0.00000920194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  23.64 
 
 		 394 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45663  predicted protein  26.05 
 
 		 356 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  28.65 
 
 		 402 aa  54.3  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  29.23 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  27.88 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.8 
 
 		 418 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  31.22 
 
 		 380 aa  53.5  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  31.44 
 
 		 430 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  26.47 
 
 		 407 aa  53.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  30.9 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0679  kynureninase  29.47 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.59 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3589  kynureninase  27.21 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3228  kynureninase  28.71 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  27.27 
 
 		 398 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.67 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1885  kynureninase  30.21 
 
 		 427 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6512  kynureninase  30.35 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14510  hypothetical protein  27.09 
 
 		 334 aa  51.2  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  29.05 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0589  aminotransferase class V  26.04 
 
 		 417 aa  50.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.43 
 
 		 411 aa  50.4  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  29.74 
 
 		 347 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  31.22 
 
 		 393 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  27.81 
 
 		 399 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  25.54 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0242  kynureninase  30.21 
 
 		 396 aa  50.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1412  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.15 
 
 		 413 aa  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  23.62 
 
 		 391 aa  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  30.99 
 
 		 355 aa  50.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  27.08 
 
 		 379 aa  50.1  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>