More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_61494 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_61494  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  100 
 
 		 430 aa  894    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0727802 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64026  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  50.12 
 
 		 421 aa  459  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.867854  normal  0.0377472 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06227  aminotransferase family protein (LolT), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13295)  32.43 
 
 		 470 aa  241  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00480  conserved hypothetical protein  31.32 
 
 		 684 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  26.44 
 
 		 407 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  26.72 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  25.53 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  24.18 
 
 		 419 aa  130  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  27.13 
 
 		 385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  26.83 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  26.83 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  26.83 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  26.83 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  26.52 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  24.02 
 
 		 399 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  26.82 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  24.59 
 
 		 390 aa  99.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  21.88 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  23.38 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  23.57 
 
 		 422 aa  93.2  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46105  predicted protein  23.35 
 
 		 485 aa  92  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916775  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  22.16 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  27.51 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  21.5 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  24.89 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  31.58 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  22.38 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  19.79 
 
 		 437 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3487  selenocysteine lyase / isopenicillin N epimerase  25.65 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0293361  normal  0.0990887 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  22.27 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1478  twin-arginine translocation pathway signal  22.65 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  25.22 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  23.51 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  21.91 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  21.04 
 
 		 476 aa  69.7  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  26.11 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0174  aminotransferase class V  26.56 
 
 		 389 aa  69.7  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0764904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  22.18 
 
 		 495 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  24.32 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  22.93 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  24.6 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  24.37 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  21.96 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  26.47 
 
 		 391 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  25.43 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  27.21 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  22.6 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2611  aminotransferase, class V  21.74 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  24.39 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  22.54 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.8 
 
 		 409 aa  63.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  21.36 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  22.08 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  23.11 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  23.92 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  22.07 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  21.56 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  23.92 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  24.23 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  23.43 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  21.72 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  23.41 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.77 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  21.46 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  26.44 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  25.15 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  22.94 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  25.15 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  19.65 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03589  aminotransferase, class V superfamily  22.71 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.301675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3538  aminotransferase class V  22.99 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0027  aminotransferase class V  20.43 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  25.16 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  19.07 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  23.17 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1852  twin-arginine translocation pathway signal  24.28 
 
 		 431 aa  57  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1642  aminotransferase, class V  24.29 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  26.95 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.74 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.67 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  22.94 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.53 
 
 		 644 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  23.81 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  26 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  24.7 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  24.28 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  23.1 
 
 		 404 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  21.66 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  27.03 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  24 
 
 		 392 aa  55.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3786  aminotransferase, class V  24.24 
 
 		 430 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  25.27 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4214  aminotransferase, class V  22.99 
 
 		 428 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2386  cysteine desulfurase  24.32 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000240874  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  39.68 
 
 		 378 aa  53.9  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2502  cysteine desulfurase  24.32 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893038  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  22.22 
 
 		 403 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  22.25 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2397  cysteine desulfurase  24.32 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0798953  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  25.86 
 
 		 380 aa  53.9  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>