More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2039 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  100 
 
 		 460 aa  945    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  34.65 
 
 		 488 aa  259  9e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  33.73 
 
 		 495 aa  257  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  31.59 
 
 		 461 aa  209  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0027  aminotransferase class V  36 
 
 		 455 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  30.26 
 
 		 476 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  31 
 
 		 469 aa  190  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  29.79 
 
 		 462 aa  176  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  27.52 
 
 		 422 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  27.25 
 
 		 393 aa  122  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  27.76 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  30.23 
 
 		 438 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  29.86 
 
 		 394 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  32.79 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  25.43 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  30.66 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  24.7 
 
 		 427 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  24.16 
 
 		 427 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  24.29 
 
 		 427 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  28.93 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  29.9 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  29.07 
 
 		 419 aa  103  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  25.77 
 
 		 413 aa  103  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.73 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.4 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  24.43 
 
 		 426 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  30.16 
 
 		 390 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  29.51 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  28.57 
 
 		 419 aa  99.8  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  27.11 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  26.41 
 
 		 385 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  26.41 
 
 		 385 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  26.41 
 
 		 385 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  25.67 
 
 		 385 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  26.41 
 
 		 464 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  26.52 
 
 		 406 aa  97.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.29 
 
 		 414 aa  97.1  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  25 
 
 		 394 aa  97.1  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  25.07 
 
 		 393 aa  96.7  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  26.55 
 
 		 392 aa  96.7  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  31 
 
 		 384 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.83 
 
 		 425 aa  95.9  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.31 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  25.14 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  22.45 
 
 		 440 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  25.53 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  26.81 
 
 		 385 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  21.93 
 
 		 445 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  35.57 
 
 		 287 aa  94  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.77 
 
 		 406 aa  93.6  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.06 
 
 		 608 aa  93.2  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  23.13 
 
 		 406 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  26.22 
 
 		 433 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1852  twin-arginine translocation pathway signal  23.35 
 
 		 431 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776832 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  23.13 
 
 		 406 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  24.51 
 
 		 437 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  23.58 
 
 		 414 aa  92.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  23.13 
 
 		 406 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4214  aminotransferase, class V  25.42 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  23.13 
 
 		 406 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  23.13 
 
 		 406 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  23.13 
 
 		 406 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  35.12 
 
 		 380 aa  90.9  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.07 
 
 		 414 aa  91.3  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.9 
 
 		 406 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  23.56 
 
 		 415 aa  91.3  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.49 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  27.81 
 
 		 880 aa  90.9  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.59 
 
 		 413 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  23.13 
 
 		 406 aa  90.5  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.36 
 
 		 404 aa  90.1  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.79 
 
 		 413 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  22.9 
 
 		 406 aa  90.1  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  22.9 
 
 		 406 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.77 
 
 		 406 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  25.8 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0174  aminotransferase class V  29.13 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0764904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.19 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.69 
 
 		 414 aa  89.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  23.58 
 
 		 394 aa  89.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  25.16 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  25.16 
 
 		 414 aa  89  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  23.74 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.56 
 
 		 629 aa  88.6  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  24.84 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0469  aminotransferase, class V  22.97 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.14848  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  27.54 
 
 		 437 aa  88.2  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  23.97 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  27.3 
 
 		 661 aa  88.2  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.37 
 
 		 414 aa  87.8  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.78 
 
 		 418 aa  87.4  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  26.41 
 
 		 408 aa  87.4  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  26.95 
 
 		 604 aa  87  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  26.95 
 
 		 604 aa  87  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.21 
 
 		 406 aa  87  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.8 
 
 		 413 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.16 
 
 		 413 aa  86.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  24.48 
 
 		 414 aa  86.3  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.77 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  26.55 
 
 		 417 aa  86.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>