More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5559 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  100 
 
 		 388 aa  775    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  39.68 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  34.31 
 
 		 399 aa  205  9e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  34.31 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  33.51 
 
 		 389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  33.77 
 
 		 407 aa  199  7e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  33.95 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  32.88 
 
 		 384 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  34.29 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  32.57 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3487  selenocysteine lyase / isopenicillin N epimerase  36.78 
 
 		 426 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0293361  normal  0.0990887 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  34.03 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  34.03 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  34.03 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  34.03 
 
 		 464 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  33.77 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0174  aminotransferase class V  36.86 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0764904  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  35.79 
 
 		 419 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64026  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  26.16 
 
 		 421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.867854  normal  0.0377472 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06227  aminotransferase family protein (LolT), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13295)  30.93 
 
 		 470 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  23.96 
 
 		 438 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  22.73 
 
 		 428 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61494  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  26.82 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0727802 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00480  conserved hypothetical protein  23.35 
 
 		 684 aa  99.4  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46105  predicted protein  28.4 
 
 		 485 aa  97.1  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916775  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  27.19 
 
 		 408 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.93 
 
 		 406 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  20.57 
 
 		 445 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.87 
 
 		 413 aa  90.5  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  26.64 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  25.89 
 
 		 401 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  23.31 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  25.94 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  27.63 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  27.78 
 
 		 381 aa  88.2  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  31.08 
 
 		 393 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  23.95 
 
 		 422 aa  86.7  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.6 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  27.71 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  25.21 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  25.53 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  26.89 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3786  aminotransferase, class V  25.28 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  22 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  26.36 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1642  aminotransferase, class V  23.54 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  22.59 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  26.84 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  22.56 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  29.49 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  27 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  27 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  27 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  22.58 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  27 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  27 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.19 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  28.03 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  24.54 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  25.94 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  26.1 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.55 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.55 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  26.41 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  26.41 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  26.41 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3538  aminotransferase class V  24.77 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  21.27 
 
 		 495 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  25 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  21.98 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.82 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1478  twin-arginine translocation pathway signal  26.76 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.19 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4214  aminotransferase, class V  21.88 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  24.49 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.44 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  22.54 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  28.21 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  22.58 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  24.01 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.37 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  22.54 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.68 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  26.58 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  26.56 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  27.56 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0836  cysteine desulfurase  24.13 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  21.93 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  22.69 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.68 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  31.52 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.22 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  21.67 
 
 		 406 aa  76.3  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  25.56 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3131  cysteine desulfurase  24.13 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  26.92 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  28.49 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  21.59 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.22 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  22.96 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>