More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1811 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  100 
 
 		 395 aa  813    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  45.72 
 
 		 407 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  42.86 
 
 		 401 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  44.56 
 
 		 393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  41.9 
 
 		 403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  43.04 
 
 		 388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  41.82 
 
 		 393 aa  306  6e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  40.1 
 
 		 395 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  42.06 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  36.86 
 
 		 393 aa  273  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  35.99 
 
 		 391 aa  269  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1257  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  37.66 
 
 		 403 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  36.18 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  36.34 
 
 		 395 aa  239  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  36 
 
 		 413 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  33.67 
 
 		 430 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  35.97 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  33.07 
 
 		 413 aa  212  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  33.76 
 
 		 393 aa  212  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  32.4 
 
 		 394 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  31.79 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38946  predicted protein  31.49 
 
 		 495 aa  176  5e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1367  aminotransferase  32.61 
 
 		 377 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.699195  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  27.78 
 
 		 394 aa  155  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  27.46 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  30.67 
 
 		 380 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.72 
 
 		 678 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  30.33 
 
 		 896 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.21 
 
 		 420 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.53 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.53 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53750  hypothetical protein  27.75 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000314396  normal  0.0111206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.53 
 
 		 418 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  27.18 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  26.84 
 
 		 879 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  29.9 
 
 		 393 aa  147  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  28.12 
 
 		 394 aa  146  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.61 
 
 		 413 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.61 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  31.27 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.47 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.77 
 
 		 414 aa  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  29.9 
 
 		 880 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  28.39 
 
 		 420 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  27.49 
 
 		 408 aa  143  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4705  hypothetical protein  27.59 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.396867  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.44 
 
 		 428 aa  143  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  27.65 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  28.61 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.06 
 
 		 413 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.19 
 
 		 403 aa  141  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.46 
 
 		 662 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.13 
 
 		 444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.68 
 
 		 449 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.65 
 
 		 657 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.57 
 
 		 413 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.32 
 
 		 414 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.35 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  28.42 
 
 		 381 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  31.17 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  29.32 
 
 		 416 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  27.25 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  27.48 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.25 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  27.66 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  29.97 
 
 		 420 aa  136  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  27.03 
 
 		 408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  27.11 
 
 		 682 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.01 
 
 		 418 aa  136  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  28.72 
 
 		 419 aa  135  9e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.01 
 
 		 419 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  28.68 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.48 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  28.4 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.75 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  28.06 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  27.95 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.97 
 
 		 425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  26.44 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.41 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  27.99 
 
 		 388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.68 
 
 		 443 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.18 
 
 		 418 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  27.15 
 
 		 422 aa  133  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.2 
 
 		 428 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  26.67 
 
 		 688 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.46 
 
 		 415 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.22 
 
 		 572 aa  132  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  29.9 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  28.72 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1818  SufS family cysteine desulfurase  26.72 
 
 		 660 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.97 
 
 		 650 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0362  selenocysteine lyase  26.72 
 
 		 685 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.556152  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  27.27 
 
 		 666 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.97 
 
 		 666 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.76 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1904  cysteine desulphurases, SufS  26.72 
 
 		 660 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.256271  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0933  putative cysteine desulfurase  26.72 
 
 		 671 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.82 
 
 		 406 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  26.17 
 
 		 626 aa  130  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>