More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0669 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0669  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 
414 aa  843    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.700717  normal  0.366803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  72.45 
 
 
404 aa  560  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0199  SufS subfamily cysteine desulfurase  69.15 
 
 
403 aa  552  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  48.64 
 
 
414 aa  373  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.61 
 
 
451 aa  375  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.98 
 
 
429 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.37 
 
 
429 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.36 
 
 
429 aa  365  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.37 
 
 
429 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  48.25 
 
 
405 aa  362  5.0000000000000005e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  48.25 
 
 
405 aa  362  9e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  48.53 
 
 
422 aa  360  4e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.06 
 
 
412 aa  358  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  47.65 
 
 
425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.02 
 
 
416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.81 
 
 
425 aa  355  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.98 
 
 
415 aa  353  4e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.28 
 
 
414 aa  351  1e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.27 
 
 
421 aa  351  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.21 
 
 
418 aa  351  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.78 
 
 
414 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.06 
 
 
414 aa  349  5e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  47.61 
 
 
414 aa  349  7e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  45.48 
 
 
414 aa  347  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.63 
 
 
408 aa  346  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.68 
 
 
406 aa  345  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  44.99 
 
 
414 aa  344  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.88 
 
 
404 aa  342  7e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  44.74 
 
 
421 aa  342  9e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.2 
 
 
406 aa  342  9e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  45.24 
 
 
420 aa  341  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.98 
 
 
409 aa  341  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.41 
 
 
413 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.2 
 
 
406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.94 
 
 
414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.31 
 
 
406 aa  340  4e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.31 
 
 
414 aa  340  4e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  45.77 
 
 
404 aa  338  7e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.2 
 
 
406 aa  338  9e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.37 
 
 
418 aa  338  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.61 
 
 
406 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.7 
 
 
406 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.04 
 
 
412 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.36 
 
 
406 aa  336  3.9999999999999995e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.69 
 
 
406 aa  336  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.66 
 
 
441 aa  335  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.92 
 
 
406 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.1 
 
 
414 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  43.7 
 
 
406 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.31 
 
 
403 aa  334  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.7 
 
 
406 aa  334  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  46.52 
 
 
408 aa  334  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.37 
 
 
427 aa  334  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  43.7 
 
 
406 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.69 
 
 
417 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.06 
 
 
413 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.91 
 
 
413 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.42 
 
 
418 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.43 
 
 
406 aa  333  4e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.42 
 
 
418 aa  333  4e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.19 
 
 
406 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.19 
 
 
406 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.46 
 
 
406 aa  332  6e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.2 
 
 
406 aa  332  6e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.19 
 
 
406 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  43.45 
 
 
416 aa  332  6e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.19 
 
 
406 aa  332  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.96 
 
 
415 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.41 
 
 
413 aa  332  8e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.26 
 
 
419 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  41.65 
 
 
414 aa  332  1e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  45.05 
 
 
415 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.21 
 
 
404 aa  330  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  42.72 
 
 
429 aa  330  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.57 
 
 
410 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.16 
 
 
406 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.93 
 
 
406 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.88 
 
 
407 aa  330  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.28 
 
 
404 aa  330  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.88 
 
 
407 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.51 
 
 
414 aa  329  7e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.61 
 
 
417 aa  328  9e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.24 
 
 
412 aa  328  9e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  42.43 
 
 
406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  45.59 
 
 
417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  42.43 
 
 
406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  42.43 
 
 
406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  45.32 
 
 
414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.55 
 
 
415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  45.07 
 
 
414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  43.83 
 
 
423 aa  327  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.63 
 
 
414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  42.43 
 
 
406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  42.43 
 
 
406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.67 
 
 
419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  42.43 
 
 
406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  42.47 
 
 
412 aa  327  3e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.55 
 
 
414 aa  327  3e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.28 
 
 
444 aa  327  3e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  45.43 
 
 
413 aa  326  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>