More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_04651 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1748  putative L-cysteine/cystine lyase  98 
 
 
400 aa  806    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.701457  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  100 
 
 
400 aa  818    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04121  putative L-cysteine/cystine lyase  59.95 
 
 
391 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0272358  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  56.85 
 
 
428 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  56.3 
 
 
400 aa  462  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0791  putative L-cysteine/cystine lyase  54.96 
 
 
388 aa  453  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51384  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  50.9 
 
 
390 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0410  putative L-cysteine/cystine lyase  49.87 
 
 
391 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.33409  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04761  putative L-cysteine/cystine lyase  49.11 
 
 
391 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  50.13 
 
 
391 aa  398  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.283231  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  40.2 
 
 
392 aa  305  6e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  38.65 
 
 
415 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  37.72 
 
 
404 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  37.47 
 
 
395 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  37.47 
 
 
395 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  37.97 
 
 
401 aa  279  6e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  35.29 
 
 
387 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  26.88 
 
 
374 aa  129  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  30.18 
 
 
381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  25.38 
 
 
367 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  26.8 
 
 
372 aa  122  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  25.38 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  28.16 
 
 
287 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  26.7 
 
 
414 aa  94.4  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  26.42 
 
 
414 aa  93.2  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  21.36 
 
 
403 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.37 
 
 
412 aa  90.5  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  26.09 
 
 
378 aa  89.7  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  23.4 
 
 
896 aa  89.7  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  25 
 
 
662 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  23.1 
 
 
368 aa  88.6  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  25.32 
 
 
413 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.12 
 
 
608 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  29.1 
 
 
380 aa  87.8  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  23.48 
 
 
414 aa  87.8  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0854  aminotransferase, class V  24.25 
 
 
403 aa  87.4  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  21.88 
 
 
393 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.89 
 
 
413 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  29.18 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  24.94 
 
 
387 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.89 
 
 
413 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.28 
 
 
414 aa  87  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.07 
 
 
418 aa  87  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.79 
 
 
409 aa  86.7  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  28 
 
 
378 aa  86.7  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.56 
 
 
414 aa  86.3  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.17 
 
 
414 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.71 
 
 
435 aa  86.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  25.23 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.72 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0840  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.3 
 
 
437 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.550163  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  22.99 
 
 
425 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  26.19 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  25.18 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  25.88 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  25 
 
 
391 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.34 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25 
 
 
657 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16930  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  25.44 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00364141  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.12 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.12 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  30.45 
 
 
388 aa  84  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  25.88 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  23.48 
 
 
377 aa  84  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.35 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  26.09 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  24.2 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  25.26 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  21.99 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.52 
 
 
679 aa  83.2  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.78 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  24.26 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  23.75 
 
 
401 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3698  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.55 
 
 
445 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.16 
 
 
572 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  23.93 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.6 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  31.16 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0743  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.55 
 
 
445 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  25.97 
 
 
429 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  24.61 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  23.14 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.86 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.89 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.04 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.6 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  23.5 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.94 
 
 
417 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.93 
 
 
610 aa  79.7  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.67 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  26.1 
 
 
665 aa  79.7  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  25.17 
 
 
417 aa  79.7  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.56 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.64 
 
 
644 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.69 
 
 
404 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.37 
 
 
605 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.83 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.37 
 
 
650 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.56 
 
 
415 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  25.56 
 
 
661 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>