More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4705 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4705  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  821    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.396867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53750  hypothetical protein  98.31 
 
 
415 aa  806    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000314396  normal  0.0111206 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  32.75 
 
 
393 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  29.19 
 
 
407 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  29.77 
 
 
401 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  30.69 
 
 
388 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  32.74 
 
 
395 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  29 
 
 
394 aa  156  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  27.5 
 
 
403 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  25.65 
 
 
391 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  30.33 
 
 
393 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  32.2 
 
 
391 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  28.26 
 
 
395 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  29.44 
 
 
393 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  26.88 
 
 
430 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  29.22 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1257  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  32.51 
 
 
403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  27.15 
 
 
413 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  27.44 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  26.81 
 
 
413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1367  aminotransferase  28.31 
 
 
377 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.699195  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  22.6 
 
 
381 aa  94  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  28.4 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  24.56 
 
 
367 aa  87  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  27.85 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04121  putative L-cysteine/cystine lyase  26.01 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0272358  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  27.91 
 
 
394 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  25.91 
 
 
430 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  24.92 
 
 
878 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0791  putative L-cysteine/cystine lyase  27.05 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51384  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  28.39 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  25 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  25.12 
 
 
401 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  25.53 
 
 
896 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  26.75 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.84 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  23.13 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  27.35 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  25.71 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  25.97 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  29.45 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38946  predicted protein  25.2 
 
 
495 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  24.5 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  25.13 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  29.84 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  27.3 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  26.13 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  27.33 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  24.09 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  36.05 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  25.77 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  25.07 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  25.93 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  22.58 
 
 
885 aa  69.7  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  31.3 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  33 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  26.24 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  26.07 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.33 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  25.74 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  23.88 
 
 
400 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  28.91 
 
 
387 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  26.87 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  21.77 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  20.67 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1324  cysteine desulfurase IscS  28.27 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00549463  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  25.09 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1517  aminotransferase, class V  29.47 
 
 
387 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  22.94 
 
 
880 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  25.82 
 
 
389 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3065  aminotransferase class V  41.58 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  25.25 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  26.11 
 
 
381 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  23.41 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  22.76 
 
 
372 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4350  aminotransferase  28.95 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.486483  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  25.06 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  20.86 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  21.78 
 
 
440 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  20.3 
 
 
425 aa  65.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  24.7 
 
 
428 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.27 
 
 
629 aa  64.7  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  24.44 
 
 
417 aa  64.7  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.59 
 
 
406 aa  64.7  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.17 
 
 
406 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.17 
 
 
406 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  19.32 
 
 
404 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  26.56 
 
 
393 aa  64.3  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.17 
 
 
406 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.17 
 
 
406 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  24.37 
 
 
374 aa  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  28.63 
 
 
395 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  23.73 
 
 
402 aa  63.9  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  28.63 
 
 
395 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.17 
 
 
406 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  32.89 
 
 
411 aa  63.5  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  25.97 
 
 
352 aa  63.5  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  26.04 
 
 
381 aa  63.5  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4214  aminotransferase, class V  23.6 
 
 
428 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.09 
 
 
433 aa  63.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>