25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00583 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00583  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  834    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0961  aminotransferase class V  45.13 
 
 
392 aa  322  7e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3941  hypothetical protein  33.25 
 
 
403 aa  210  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0778882  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6950  kynureninase  31.68 
 
 
403 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3355  kynureninase  33.7 
 
 
392 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3281  kynureninase  33.52 
 
 
392 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3164  kynureninase  33.24 
 
 
399 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  25.9 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  25.37 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  22.31 
 
 
384 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1437  aminotransferase class V  23.12 
 
 
422 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000186875 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  20.6 
 
 
376 aa  51.2  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  21.49 
 
 
381 aa  50.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  22.43 
 
 
415 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.63 
 
 
410 aa  47.4  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  24.56 
 
 
381 aa  46.6  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  21.82 
 
 
379 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1432  kynureninase  23.65 
 
 
426 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0731734  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46105  predicted protein  20.45 
 
 
485 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916775  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  21.15 
 
 
409 aa  44.3  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3396  kynureninase  22.38 
 
 
401 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337289  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1353  kynureninase  22.57 
 
 
423 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  22.51 
 
 
377 aa  43.9  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  22.55 
 
 
414 aa  43.9  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  22.55 
 
 
414 aa  43.1  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>