89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3941 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3941  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  802    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0778882  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0961  aminotransferase class V  41.39 
 
 
392 aa  235  8e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6950  kynureninase  41.92 
 
 
403 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3355  kynureninase  41.97 
 
 
392 aa  232  9e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3164  kynureninase  42.49 
 
 
399 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3281  kynureninase  42.49 
 
 
392 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00583  hypothetical protein  33.51 
 
 
396 aa  220  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  27.76 
 
 
379 aa  90.1  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  29.96 
 
 
384 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  22.74 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  28.44 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  23.01 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  23.12 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  22.8 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  21.97 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0309  aminotransferase class V  22.69 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  27.14 
 
 
387 aa  69.7  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0300  aminotransferase class V  22.41 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0304  aminotransferase class V  22.41 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3452  aminotransferase, class V  22 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.237823  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0305  aminotransferase class V  22.13 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  24.39 
 
 
379 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5245  kynureninase  32.4 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.668711 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02180  Kynureninase  33.33 
 
 
425 aa  64.7  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.641919  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  27.5 
 
 
377 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  23.91 
 
 
368 aa  63.5  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  22.5 
 
 
378 aa  63.2  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3511  kynureninase  32.38 
 
 
427 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  27.5 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  27.06 
 
 
391 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  27.04 
 
 
377 aa  60.5  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1542  kynureninase  33.97 
 
 
423 aa  59.7  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0917927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  27.94 
 
 
371 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.746937 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  21.05 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  26.78 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0411  aminotransferase, class V  24.3 
 
 
357 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  26.73 
 
 
370 aa  57.4  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1230  kynureninase  32.79 
 
 
393 aa  57  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0974944 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  26.3 
 
 
411 aa  56.2  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  26.09 
 
 
377 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  25.95 
 
 
381 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1432  kynureninase  30.04 
 
 
426 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0731734  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  28.79 
 
 
367 aa  53.5  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2025  aminotransferase class V  26.99 
 
 
418 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2118  kynureninase  29.36 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.489178 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2085  kynureninase  29.44 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.867817  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1353  kynureninase  27.42 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2164  kynureninase  26.92 
 
 
434 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0484937  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14510  hypothetical protein  29.88 
 
 
334 aa  52.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4470  kynureninase  28.81 
 
 
416 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479013 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0922  kynureninase  29.66 
 
 
413 aa  51.2  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.50677  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0589  aminotransferase class V  30.27 
 
 
417 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3530  kynureninase  28.32 
 
 
429 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37610  kynureninase  29.65 
 
 
416 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88589  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3208  kynureninase  30.15 
 
 
416 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2620  kynureninase  30.71 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1389  kynureninase  29.17 
 
 
413 aa  50.8  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0130616  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3396  kynureninase  32.11 
 
 
401 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337289  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  24.77 
 
 
378 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1156  kynureninase  29.69 
 
 
435 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1471  kynureninase  27.27 
 
 
409 aa  50.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0396616  normal  0.0356277 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4022  aminotransferase class V  28.57 
 
 
372 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1903  kynureninase  24.73 
 
 
428 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.880029  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  26.22 
 
 
376 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0822  kynureninase  28.63 
 
 
416 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.632925  hitchhiker  0.00000920194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2100  kynureninase  24.94 
 
 
422 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  25.84 
 
 
393 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1473  kynureninase  29.25 
 
 
409 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3905  kynureninase  27.55 
 
 
430 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.633116 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.06 
 
 
429 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2650  kynureninase  28.5 
 
 
418 aa  46.6  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.06 
 
 
429 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3019  kynureninase  29.95 
 
 
425 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3180  cysteine sulfinate desulfinase  25.95 
 
 
401 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7639  kynureninase  28.37 
 
 
409 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3396  kynureninase  31.86 
 
 
413 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1518  kynureninase  23.04 
 
 
420 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0681881  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1448  kynureninase  27.73 
 
 
425 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83502  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2921  kynureninase  25.71 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0759  hydrolase protein  29.46 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0709  kynureninase  29.03 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.540456  normal  0.132012 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.93 
 
 
429 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0679  kynureninase  27.63 
 
 
413 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  27.59 
 
 
403 aa  43.9  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  25.32 
 
 
401 aa  43.5  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1437  aminotransferase class V  27.63 
 
 
422 aa  43.1  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000186875 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.16 
 
 
406 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0808  kynureninase  28.22 
 
 
418 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0775  kynureninase  28.57 
 
 
417 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.21051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>