85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0961 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0961  aminotransferase class V  100 
 
 
392 aa  764    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00583  hypothetical protein  45.13 
 
 
396 aa  322  7e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3941  hypothetical protein  41.58 
 
 
403 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0778882  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6950  kynureninase  39.05 
 
 
403 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3355  kynureninase  38.48 
 
 
392 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3164  kynureninase  38.89 
 
 
399 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3281  kynureninase  39.27 
 
 
392 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  25.08 
 
 
368 aa  69.3  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  28.14 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  26.09 
 
 
384 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  21.45 
 
 
376 aa  63.5  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  28.81 
 
 
362 aa  63.5  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  27.61 
 
 
355 aa  60.1  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  27.73 
 
 
379 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  25.6 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  28.98 
 
 
391 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  27.01 
 
 
341 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  28.29 
 
 
347 aa  53.5  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3228  kynureninase  26.95 
 
 
416 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2620  kynureninase  32.38 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  24.66 
 
 
388 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  24.45 
 
 
374 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  25.56 
 
 
378 aa  51.6  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2118  kynureninase  27.85 
 
 
409 aa  50.1  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.489178 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3452  aminotransferase, class V  22.61 
 
 
381 aa  49.7  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.237823  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  25.97 
 
 
382 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  24.35 
 
 
373 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  27.42 
 
 
371 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.746937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0734  kynureninase  27.34 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0719  kynureninase  29.79 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.76256  normal  0.281792 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0352  kynureninase, putative  28 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.543237  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1054  kynureninase  28 
 
 
416 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2385  aminotransferase class V  29.84 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00212379  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  24.32 
 
 
386 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0099  kynureninase  28 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0710  kynureninase  28.4 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0491742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0893  kynureninase  28 
 
 
416 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2486  kynureninase  28 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  31.73 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0651  kynureninase  28 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.131802  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0896  kynureninase  28 
 
 
416 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  24.71 
 
 
390 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1463  aminotransferase class V  28 
 
 
352 aa  47.4  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  26.77 
 
 
415 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0265  kynureninase  28.99 
 
 
373 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0507  kynureninase  29.3 
 
 
416 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0151824 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  28.79 
 
 
384 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1389  kynureninase  36.52 
 
 
413 aa  47  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0130616  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  26.77 
 
 
401 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  29.07 
 
 
384 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  24.06 
 
 
373 aa  46.6  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  30.43 
 
 
379 aa  46.6  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  26.25 
 
 
370 aa  46.6  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3396  kynureninase  31.44 
 
 
401 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337289  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  27.52 
 
 
422 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  26.88 
 
 
383 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  30.71 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1967  kynureninase  29.54 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  31.1 
 
 
384 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  23.33 
 
 
403 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2602  kynureninase  29.54 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2578  kynureninase  29.54 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.649182  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  30.08 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  26.29 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0679  kynureninase  27.54 
 
 
413 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5245  kynureninase  28.07 
 
 
411 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.668711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1772  YheO domain protein  33.33 
 
 
580 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2273  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.72 
 
 
442 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46105  predicted protein  40.38 
 
 
485 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916775  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2626  kynureninase  29.87 
 
 
417 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2497  kynureninase  29.87 
 
 
417 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.651765  normal  0.855444 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5909  kynureninase  29.11 
 
 
417 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  27.61 
 
 
392 aa  43.9  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1799  aminotransferase, class V  29.67 
 
 
347 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  26.91 
 
 
345 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1230  kynureninase  28.75 
 
 
393 aa  43.5  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0974944 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  23.6 
 
 
404 aa  43.5  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0808  kynureninase  29.79 
 
 
418 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3072  aminotransferase class V  28.49 
 
 
357 aa  43.5  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237704  decreased coverage  0.0000000313902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5841  aminotransferase class V  28.16 
 
 
333 aa  43.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0709  kynureninase  28.21 
 
 
417 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.540456  normal  0.132012 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  25.15 
 
 
379 aa  43.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0775  kynureninase  28.21 
 
 
417 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2921  kynureninase  26.75 
 
 
414 aa  43.1  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  30.6 
 
 
380 aa  43.1  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>