More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1257 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1257  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  100 
 
 		 403 aa  807    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  44.05 
 
 		 407 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  42.45 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  42.78 
 
 		 393 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  37.28 
 
 		 403 aa  268  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  38.6 
 
 		 395 aa  266  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  40.05 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  39.95 
 
 		 393 aa  256  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  40.31 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  35.06 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  35.29 
 
 		 388 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  35.62 
 
 		 430 aa  215  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  31.55 
 
 		 391 aa  206  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  36.91 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  35.38 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  34.96 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  31.94 
 
 		 413 aa  186  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  34.13 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  32.33 
 
 		 393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  30.93 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38946  predicted protein  29.89 
 
 		 495 aa  156  6e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1367  aminotransferase  33.6 
 
 		 377 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.699195  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  30.96 
 
 		 394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4705  hypothetical protein  32.09 
 
 		 415 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.396867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53750  hypothetical protein  32.09 
 
 		 415 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000314396  normal  0.0111206 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  26.42 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.43 
 
 		 444 aa  126  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  28.82 
 
 		 401 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  23.87 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  23.54 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.07 
 
 		 885 aa  119  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.63 
 
 		 416 aa  119  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  25.52 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0328  class-V aminotransferase  30.28 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.2 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.44 
 
 		 662 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  28.7 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  27.74 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.61 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  26.82 
 
 		 414 aa  113  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.25 
 
 		 657 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  25.67 
 
 		 404 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  26.82 
 
 		 414 aa  113  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  27.3 
 
 		 665 aa  113  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.19 
 
 		 414 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.3 
 
 		 418 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  27.06 
 
 		 420 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  27.46 
 
 		 416 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  24.81 
 
 		 394 aa  112  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  25.44 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  26.79 
 
 		 626 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.83 
 
 		 678 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  24.6 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.05 
 
 		 644 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  24.11 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.27 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2091  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.01 
 
 		 419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000201738 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  27.14 
 
 		 423 aa  110  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.87 
 
 		 416 aa  110  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.98 
 
 		 610 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  29.17 
 
 		 383 aa  110  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.39 
 
 		 418 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  23.98 
 
 		 381 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  27.87 
 
 		 416 aa  109  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.99 
 
 		 413 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.39 
 
 		 418 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.83 
 
 		 406 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  27.62 
 
 		 387 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.99 
 
 		 413 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.43 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  25.5 
 
 		 896 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  23.5 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.38 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.39 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  29.63 
 
 		 393 aa  107  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.06 
 
 		 414 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.41 
 
 		 407 aa  106  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  22.66 
 
 		 392 aa  106  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.35 
 
 		 673 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  27.73 
 
 		 604 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  27.73 
 
 		 604 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.46 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.35 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  24.88 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  27.59 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.1 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  25.13 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.35 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.41 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  24.87 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.76 
 
 		 605 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  27.68 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.72 
 
 		 409 aa  104  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.66 
 
 		 629 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.95 
 
 		 560 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.35 
 
 		 406 aa  104  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.06 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.31 
 
 		 404 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>