More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0328 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0328  class-V aminotransferase  100 
 
 		 409 aa  781    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0198  aminotransferase class V  43.77 
 
 		 376 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2218  aminotransferase class V  43.21 
 
 		 426 aa  219  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245886  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1683  hypothetical protein  43.4 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0813742  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13731  hypothetical protein  39.22 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.931634  normal  0.801703 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1319  aminotransferase, class V  33.41 
 
 		 370 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.415284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0981  aminotransferase class V  36.47 
 
 		 369 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024687  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4878  aminotransferase, class V  37.01 
 
 		 375 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5246  aminotransferase, class V  37.01 
 
 		 375 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.728541  normal  0.933363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4967  aminotransferase, class V  37.01 
 
 		 375 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4836  aminotransferase class V  33.25 
 
 		 363 aa  170  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0889282  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  33.43 
 
 		 388 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  30.77 
 
 		 393 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5482  aminotransferase, class V  30.98 
 
 		 359 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0362995  normal  0.199376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  32.12 
 
 		 393 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  39.42 
 
 		 395 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  27.14 
 
 		 407 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  29.67 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  27.66 
 
 		 401 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  39.32 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  28.24 
 
 		 403 aa  113  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  23.59 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  30.77 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  31.73 
 
 		 413 aa  99.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1257  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  29.25 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  25.81 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  37.02 
 
 		 395 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  28.63 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  28.98 
 
 		 394 aa  86.3  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38946  predicted protein  26.44 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  24.78 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  24.44 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  24.44 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  23.9 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.33 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  30.05 
 
 		 393 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  25.99 
 
 		 665 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  22.29 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  30 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  28.67 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  27.8 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1367  aminotransferase  30.7 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.699195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  31.55 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  29.76 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  26.36 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  36.18 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  30.95 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  22.62 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  29.22 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  34.86 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  25.28 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.38 
 
 		 644 aa  70.5  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.98 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  27.06 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0199  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.8 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.75 
 
 		 560 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.4 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  26.87 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  28.68 
 
 		 878 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  24.59 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  25.58 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.81 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.34 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  25.58 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.23 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  29.65 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  28.49 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  34.13 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  21.39 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.11 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  28.04 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  27.27 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3079  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000765371  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  27.22 
 
 		 426 aa  67  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.96 
 
 		 414 aa  67  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  21.08 
 
 		 417 aa  67  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  34.97 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  26.18 
 
 		 896 aa  66.6  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  29.12 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  28.49 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  30.25 
 
 		 403 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  30.14 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.27 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  32.53 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.69 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.69 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  33.33 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  26.13 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  31.25 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.37 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  28.98 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  34.55 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  22.43 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  25 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  26.7 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  27.62 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  27.51 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.79 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  31.14 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>