More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4684 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4684  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 323 aa  668    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2283  LysR family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 306 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95602  normal  0.350255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2367  LysR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 306 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4884  LysR family transcriptional regulator  57.79 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000596604  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1637  LysR family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 310 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1614  LysR family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 310 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3413  LysR family transcriptional regulator  59.14 
 
 		 306 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3226  LysR family transcriptional regulator  56.48 
 
 		 309 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2502  LysR family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 308 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4143  transcriptional regulator, LysR family  55.15 
 
 		 303 aa  360  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4901  LysR family transcriptional regulator  54.49 
 
 		 303 aa  358  6e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.795056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4125  LysR family transcriptional regulator  58.05 
 
 		 303 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7099  LysR family transcriptional regulator  57.95 
 
 		 303 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0080  transcriptional regulator, LysR family  55.03 
 
 		 303 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2573  LysR family transcriptional regulator  54.15 
 
 		 303 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.888641  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3893  putative transcriptional regulator  52.17 
 
 		 317 aa  305  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.32212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1678  transcriptional regulator, LysR family  47.65 
 
 		 305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2436  LysR family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399633  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5031  LysR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 302 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3189  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 302 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.77747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6313  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 317 aa  245  8e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2473  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0339  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0086  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1042  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0880  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.803519  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0638  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0883  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.427217  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3565  transcriptional regulator, LysR family  37.84 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2614  LysR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.68 
 
 		 298 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3033  LysR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0273235  normal  0.89504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3183  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 299 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224527  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4702  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3196  transcriptional regulator, LysR family  35.42 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00241672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2590  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767848  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1980  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0707  LysR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256747  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2534  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 299 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.487932  normal  0.277262 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 296 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  37.59 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3751  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 298 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.587681  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0131  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2019  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4908  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  34.48 
 
 		 290 aa  192  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4060  transcriptional regulator, LysR family protein  36.88 
 
 		 288 aa  192  8e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.833958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2792  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.54 
 
 		 295 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4851  transcriptional regulator, LysR family  35.33 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204914  normal  0.243062 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0145  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2638  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 294 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5921  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3219  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0231  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1818  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000927  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 289 aa  186  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0549  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 296 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0269293 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.93 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0979  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 307 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0139  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154099 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3070  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273364 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0915  transcriptional regulator, LysR family  37.92 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  35.46 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1119  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 304 aa  184  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.503847  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2357  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.99 
 
 		 301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.673893  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1039  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4864  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635327 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17760  Transcriptional regulator, LysR family  38.28 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  34.84 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35890  Regulatory protein, LysR family  36.21 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4360  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 318 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4228  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2683  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2248  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3529  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  35.52 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2700  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.469247  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3137  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3304  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0884385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1997  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2286  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1711  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.530913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2017  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.304165  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2719  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4156  transcriptional regulator, LysR family  37.06 
 
 		 318 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0111  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 320 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.248059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>