More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4125 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4125  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  607  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4884  LysR family transcriptional regulator  71.19 
 
 		 321 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000596604  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3413  LysR family transcriptional regulator  72.85 
 
 		 306 aa  444  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1637  LysR family transcriptional regulator  70.76 
 
 		 310 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1614  LysR family transcriptional regulator  70.76 
 
 		 310 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7099  LysR family transcriptional regulator  71.62 
 
 		 303 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4143  transcriptional regulator, LysR family  66.01 
 
 		 303 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2502  LysR family transcriptional regulator  64.33 
 
 		 308 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0080  transcriptional regulator, LysR family  63.42 
 
 		 303 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4901  LysR family transcriptional regulator  61.79 
 
 		 303 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.795056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3226  LysR family transcriptional regulator  62.91 
 
 		 309 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2283  LysR family transcriptional regulator  64.31 
 
 		 306 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95602  normal  0.350255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2367  LysR family transcriptional regulator  62.63 
 
 		 306 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4684  LysR family transcriptional regulator  58.05 
 
 		 323 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2573  LysR family transcriptional regulator  58.09 
 
 		 303 aa  368  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.888641  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3893  putative transcriptional regulator  59.47 
 
 		 317 aa  358  6e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.32212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1678  transcriptional regulator, LysR family  48.49 
 
 		 305 aa  280  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5031  LysR family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 302 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3189  LysR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 302 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.77747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2436  LysR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399633  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6313  transcriptional regulator, LysR family  42.07 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4702  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2719  LysR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2040  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  normal  0.369183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  35.35 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 294 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 309 aa  195  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06550  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213986  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.43 
 
 		 298 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3196  transcriptional regulator, LysR family  35.4 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00241672  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0131  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 296 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4164  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0145  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2286  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5921  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2679  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0566483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3691  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3565  transcriptional regulator, LysR family  37.33 
 
 		 298 aa  185  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0674  transcriptional regulator, LysR family  34.46 
 
 		 315 aa  185  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2638  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 294 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0157  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2698  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0549  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0269293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3170  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2545  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0880  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.803519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2534  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.487932  normal  0.277262 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  36.05 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0339  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6355  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2473  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1042  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4908  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0086  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0638  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1473  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127163  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0831  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2880  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.957922  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4093  transcriptional regulator, LysR family  35.67 
 
 		 344 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1711  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.530913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6256  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 304 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3751  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.587681  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2700  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 303 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.469247  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.36 
 
 		 299 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0275  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 320 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0423323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0873  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 320 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.493245  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1155  LysR substrate binding domain-containing protein  36.95 
 
 		 349 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.947085  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2368  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 313 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1002  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 320 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 323 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0707  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 294 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256747  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0883  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 294 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.427217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0995  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 349 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291336  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  34.69 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3033  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0273235  normal  0.89504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3183  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224527  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17760  Transcriptional regulator, LysR family  39.06 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2614  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1818  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4738  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.44438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0065  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2683  transcriptional regulator, LysR family  37.88 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2590  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767848  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0363  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1980  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  32.54 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1454  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 296 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.508797  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>