More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3643 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 268 aa  531  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  82.02 
 
 		 269 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747095  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.34 
 
 		 268 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.6 
 
 		 268 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.6 
 
 		 268 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.607638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.6 
 
 		 268 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.21 
 
 		 268 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.764612  normal  0.80619 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01400  predicted spermidine/putrescine transporter subunit  82.06 
 
 		 264 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.06 
 
 		 264 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0971316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01411  hypothetical protein  82.06 
 
 		 264 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1622  ABC transporter, permease protein  82.06 
 
 		 264 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1527  ABC transporter, permease protein  82.06 
 
 		 264 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.68 
 
 		 264 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2048  ABC transporter, permease protein  81.68 
 
 		 264 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000240578 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1731  ABC transporter, permease protein  81.3 
 
 		 264 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000945918 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.73 
 
 		 271 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  hitchhiker  0.00965408 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.74 
 
 		 269 aa  333  2e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.98 
 
 		 269 aa  330  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3619  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.36 
 
 		 264 aa  323  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.18 
 
 		 273 aa  316  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.138975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3426  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.64 
 
 		 270 aa  314  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.3 
 
 		 271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.4 
 
 		 270 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.608354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.07 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.722828  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 		 284 aa  172  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446798  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1543  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  38.08 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.414706 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  35.29 
 
 		 266 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  34.51 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  34.9 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  34.9 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  34.9 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  34.9 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  38.61 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  34.51 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 		 277 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 		 285 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.372706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0283  polyamine ABC-transporter, inner membrane subunit  36.17 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.463421  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 		 268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0038105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395984  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.82 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  0.45751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2609  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  41.03 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2603  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0922779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  41.03 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2805  ornithine carbamoyltransferase  35.95 
 
 		 276 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0949  ornithine carbamoyltransferase  32.53 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48730  polyamine transport protein PotI  35.29 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1134  ornithine carbamoyltransferase  31.25 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0016  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  32.7 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.7 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 		 267 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1064  ornithine carbamoyltransferase  30.59 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 		 271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0724945  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0166478  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1008  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.81 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.507644  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3189  Ornithine carbamoyltransferase  31.64 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.72371  normal  0.0258065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3144  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.93 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1169  ornithine carbamoyltransferase  31.64 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.017225  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1202  ornithine carbamoyltransferase  31.64 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 		 269 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.458756  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1111  ornithine carbamoyltransferase  31.64 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00240175  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1012  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.86 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0286  ornithine carbamoyltransferase  33.46 
 
 		 297 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470057  normal  0.688264 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 		 275 aa  125  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 		 268 aa  125  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.024318  normal  0.589307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5177  ornithine carbamoyltransferase  33.07 
 
 		 297 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00577642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5084  ornithine carbamoyltransferase  33.07 
 
 		 297 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.182213  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 		 289 aa  125  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698414  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1847  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.92 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0489966  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1958  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.03 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3925  ornithine carbamoyltransferase  34.82 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0208351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319859  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6836  putrescine ABC transporter membrane protein  35.18 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.623194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5237  ornithine carbamoyltransferase  34.44 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1609  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  34.41 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0392744  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3672  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.06 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4637  Ornithine carbamoyltransferase  34.3 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476846  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4861  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.3 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.95 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.91 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5301  putrescine ABC transporter, permease protein  32.3 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5401  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.3 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.424261  hitchhiker  0.00155673 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0395  polyamine transport protein PotI  32.94 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1479  ABC transporter, permease protein  36.51 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0195961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>