More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2236 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2236  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000435819  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2426  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2050  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1959  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.400986  normal  0.283843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2301  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2046  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 226 aa  198  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.095715  hitchhiker  0.000000000691151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1904  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 226 aa  198  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00970528  hitchhiker  0.0000356769 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2416  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 226 aa  198  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134995  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2074  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00164535  hitchhiker  0.00140528 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1941  two component transcriptional regulator  48.92 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2294  two component transcriptional regulator  48.92 
 
 		 226 aa  194  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000876575  normal  0.575243 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1718  response regulator receiver protein  47.56 
 
 		 224 aa  191  8e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0955826  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2150  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  45.09 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.175243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2316  response regulator receiver protein  47.58 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000147543  hitchhiker  0.000888492 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1936  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0482001  normal  0.0104585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1906  transcriptional regulatory protein-like protein  45.66 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00141074  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0676  two comoponent transcriptional regulator  35.34 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2264  transcriptional regulator CpxR  34.98 
 
 		 228 aa  121  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000005667  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  36.91 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  33.93 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  35.27 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  35.84 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2797  transcriptional regulator, CpxR  34.96 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000288823  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000851  probable transcriptional regulator SyrB  32.89 
 
 		 221 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00675785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3432  response regulator receiver protein  36.09 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000345172  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3461  response regulator receiver  35.11 
 
 		 226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06763  transcriptional regulatory protein CpxR  32.44 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  37.23 
 
 		 232 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1831  two component transcriptional regulator  32.61 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.989444  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  37.23 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1750  transcriptional regulatory protein CpxR  31.51 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000216865  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3570  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000660562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.29 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0794  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.665518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0281  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000215794  unclonable  0.0000000255624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1483  two component transcriptional regulator  32.03 
 
 		 225 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0288957  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  31.03 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3920  two component transcriptional regulator  30.18 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15610  Response regulator, transciptional regulatory protein  31.74 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0572115  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00535  Transcriptional regulatory protein CpxR  34.35 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2301  two component transcriptional regulator  32.17 
 
 		 244 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52250  two-component response regulator  31.39 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.220903 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0279  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000622263  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  34.74 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3850  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  37.23 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0319  two component transcriptional regulator  32.6 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000369721  hitchhiker  0.00000000968682 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3933  two component transcriptional regulator  34.67 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956729  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4346  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  35.02 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  0.0000000817459 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4457  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  35.02 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4132  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  35.06 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000494358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0081  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  35.06 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4390  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  35.02 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.918423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  35.02 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4276  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  35.02 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0084  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  35.06 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.601085  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1213  two component transcriptional regulator  31.56 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4033  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  36.8 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4581  two-component response regulator  30.57 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382311  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00938  transcriptional regulatory protein CpxR  30.52 
 
 		 236 aa  104  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000268904  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3534  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 234 aa  104  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3793  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  28.51 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5196  DNA-binding response regulator CreB  30.04 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  32.48 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03798  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CpxA  35.19 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.48 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4072  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.19 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.476785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03747  hypothetical protein  35.19 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0830559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4060  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  35.02 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4446  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  35.19 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5367  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  35.19 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0360  DNA-binding response regulator CreB  30.3 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.48199  normal  0.18469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4105  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  35.19 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.393063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  35.19 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0517203  normal  0.0145886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3792  two component transcriptional regulator  30.74 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000277452 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4392  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  35.19 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4143  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  35.19 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7488  two component response regulator  28 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2145  DNA-binding response regulator  33.7 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1731  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.135854  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  30.97 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4810  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  36.36 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22760  putative two-component response regulator  30.13 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4066  two component transcriptional regulator  31.72 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.945155 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  29.87 
 
 		 235 aa  101  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  31.47 
 
 		 240 aa  101  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4503  winged helix family two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  31.47 
 
 		 240 aa  101  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1408  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0248977  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03088  two-component response regulator transcription regulator protein  26.67 
 
 		 246 aa  101  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  34.25 
 
 		 245 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1651  winged helix family two component transcriptional regulator  36.2 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.514526  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.9 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  31 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  29.33 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.9 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4009  two component transcriptional regulator  30.26 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597595  hitchhiker  0.0000110419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1253  two component transcriptional regulator  31.28 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  hitchhiker  0.000294124 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3691  two component transcriptional regulator  32.22 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0357  DNA-binding response regulator CreB  31.03 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.501858  normal  0.680539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>