85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4286 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4286  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  654    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5670  hypothetical protein  49.41 
 
 		 346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0551322  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1921  hypothetical protein  43.65 
 
 		 351 aa  209  6e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4260  hypothetical protein  46.03 
 
 		 346 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20807  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1741  hypothetical protein  39.8 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2895  hypothetical protein  42.53 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2497  hypothetical protein  40.72 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2236  hypothetical protein  40.43 
 
 		 371 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000412542 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1249  translocation protein TolB  28.7 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000163249  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1156  translocation protein TolB  26.4 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2902  translocation protein TolB  26.4 
 
 		 428 aa  55.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000513444  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3087  translocation protein TolB  26.96 
 
 		 430 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000560471  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  25.69 
 
 		 430 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  24 
 
 		 433 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  24 
 
 		 433 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  24.86 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  25.14 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  23.67 
 
 		 432 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  28.45 
 
 		 443 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  23.67 
 
 		 414 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  24.57 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  26.14 
 
 		 432 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  26.14 
 
 		 432 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  30.77 
 
 		 427 aa  50.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2956  translocation protein TolB  24.79 
 
 		 430 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000231645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1397  translocation protein TolB  24.79 
 
 		 430 aa  49.7  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2868  translocation protein TolB  24.79 
 
 		 430 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034107  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  27.59 
 
 		 440 aa  49.7  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  23.73 
 
 		 423 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  26.88 
 
 		 434 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  26.34 
 
 		 432 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  29.06 
 
 		 438 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  25.7 
 
 		 430 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  26.34 
 
 		 434 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  51.06 
 
 		 1067 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  32.22 
 
 		 430 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  32.22 
 
 		 430 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  25.91 
 
 		 425 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  30.59 
 
 		 422 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.59 
 
 		 422 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  33.75 
 
 		 450 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  23.56 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  27.59 
 
 		 429 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  23.85 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  23.85 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  23.85 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0662  translocation protein TolB  23.48 
 
 		 430 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000673794  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  23.85 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  42.47 
 
 		 1069 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00700  translocation protein TolB precursor  23.48 
 
 		 430 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000197077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0763  translocation protein TolB  23.48 
 
 		 431 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000112892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2915  translocation protein TolB  23.48 
 
 		 430 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000243248  normal  0.51862 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0844  translocation protein TolB  23.85 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0211285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  30.14 
 
 		 426 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0769  translocation protein TolB  23.48 
 
 		 430 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000591343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  30.26 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0843  translocation protein TolB  23.48 
 
 		 430 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000968933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00689  hypothetical protein  23.48 
 
 		 430 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000219845  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  27.59 
 
 		 421 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2895  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.48 
 
 		 430 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000023315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  41.1 
 
 		 1060 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  24.19 
 
 		 431 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  30 
 
 		 403 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1238  translocation protein TolB  23.39 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00586154  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.87 
 
 		 448 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  30 
 
 		 436 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  27.5 
 
 		 433 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  30 
 
 		 431 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  30.67 
 
 		 424 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  30 
 
 		 431 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  27.5 
 
 		 433 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  27.5 
 
 		 463 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  27.5 
 
 		 431 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  28.95 
 
 		 450 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  30 
 
 		 431 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  30 
 
 		 431 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  23.08 
 
 		 428 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  39.19 
 
 		 1125 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  28.41 
 
 		 572 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  27.59 
 
 		 415 aa  43.1  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  27.5 
 
 		 430 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  27.5 
 
 		 430 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  28.75 
 
 		 446 aa  42.7  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  24.63 
 
 		 450 aa  42.4  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  27.5 
 
 		 463 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>