17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1741 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1741  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  634    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5670  hypothetical protein  43.43 
 
 		 346 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0551322  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4286  hypothetical protein  39.8 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1921  hypothetical protein  43.68 
 
 		 351 aa  192  9e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2895  hypothetical protein  43.43 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4260  hypothetical protein  41.83 
 
 		 346 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20807  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2497  hypothetical protein  39.77 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2236  hypothetical protein  35.96 
 
 		 371 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000412542 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  31.9 
 
 		 449 aa  53.1  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  43.33 
 
 		 439 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 		 642 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  27.08 
 
 		 440 aa  43.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  31.18 
 
 		 431 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  31.18 
 
 		 431 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0844  translocation protein TolB  31.18 
 
 		 431 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0211285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  31.18 
 
 		 431 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  31.18 
 
 		 431 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>