8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5670 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5670  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  709    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0551322  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4260  hypothetical protein  59.71 
 
 		 346 aa  388  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20807  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1921  hypothetical protein  50 
 
 		 351 aa  318  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2895  hypothetical protein  49.32 
 
 		 322 aa  269  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4286  hypothetical protein  49.41 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1741  hypothetical protein  43.43 
 
 		 319 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2497  hypothetical protein  38.33 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2236  hypothetical protein  37.74 
 
 		 371 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000412542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>