More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0238 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4488  sensor histidine kinase  79 
 
 		 438 aa  683    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 438 aa  895    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0244  histidine kinase  96.8 
 
 		 438 aa  840    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0241  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  97.95 
 
 		 438 aa  828    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0238  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  96.58 
 
 		 438 aa  840    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0356  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  94.06 
 
 		 438 aa  817    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0239  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  75.51 
 
 		 438 aa  648    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000059891 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  75.29 
 
 		 438 aa  645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0240  ATPase domain-containing protein  75.74 
 
 		 438 aa  652    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000252659 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0589  histidine kinase  33.74 
 
 		 437 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 439 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28570  sensory histidine protein kinase  31.65 
 
 		 440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  33.11 
 
 		 439 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000685276  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 439 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  33.04 
 
 		 444 aa  196  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 439 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 		 441 aa  190  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000460347  hitchhiker  0.000037431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  32.08 
 
 		 445 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 442 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3380  sensor histidine kinase  32.27 
 
 		 439 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625161  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  29.4 
 
 		 445 aa  186  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 442 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  30.34 
 
 		 442 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  29.84 
 
 		 441 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 442 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 441 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 441 aa  176  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  29.47 
 
 		 442 aa  176  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 442 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 442 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  29.37 
 
 		 442 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3771  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 437 aa  172  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.429615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183643  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1996  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540244  normal  0.136551 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0311  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 484 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0123  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 450 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1914  histidine kinase  33.49 
 
 		 451 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 452 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 454 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 464 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 465 aa  142  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3157  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0710965 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1263  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.2 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000081586  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  28.95 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3512  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  29.15 
 
 		 462 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  29.31 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 459 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 461 aa  137  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  31.65 
 
 		 482 aa  136  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0429  sensor histidine kinase FeuQ  31.29 
 
 		 473 aa  135  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  31.15 
 
 		 458 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  27.66 
 
 		 449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  34.18 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526543  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  25.89 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  27.71 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4141  histidine kinase  31.52 
 
 		 454 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 441 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  25.89 
 
 		 448 aa  131  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 454 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 474 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 441 aa  131  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4648  sensor histidine kinase  31.34 
 
 		 454 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 465 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  33.21 
 
 		 429 aa  129  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  33.46 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2936  histidine kinase  31.29 
 
 		 517 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00120898  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  29.97 
 
 		 317 aa  127  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3909  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 454 aa  127  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000571443  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 442 aa  126  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 453 aa  126  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 		 460 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  26.5 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  33.09 
 
 		 469 aa  124  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3818  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 454 aa  123  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00854299  decreased coverage  0.0034747 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4026  ATPase domain-containing protein  33.33 
 
 		 454 aa  123  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3381  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 463 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  27.08 
 
 		 436 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 481 aa  120  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 439 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  24.78 
 
 		 474 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3684  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.714122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>