More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0929 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 459 aa  915    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  48.8 
 
 		 458 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.35 
 
 		 465 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.7 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  47.82 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 		 463 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.17 
 
 		 464 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.8 
 
 		 465 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.58 
 
 		 475 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 		 471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  44.9 
 
 		 471 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 		 460 aa  338  9e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  44.9 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 		 463 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 		 481 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 		 472 aa  320  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 		 461 aa  319  6e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  39.48 
 
 		 471 aa  303  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 		 461 aa  301  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 467 aa  299  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  38.2 
 
 		 467 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.68 
 
 		 490 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  39.95 
 
 		 436 aa  293  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  36.12 
 
 		 449 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  39.86 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  43.55 
 
 		 490 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 441 aa  289  6e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.96 
 
 		 478 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  38.44 
 
 		 436 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  37.64 
 
 		 448 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 463 aa  277  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 461 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 		 459 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  38.01 
 
 		 462 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  38.48 
 
 		 464 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 467 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  40.55 
 
 		 482 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 446 aa  263  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.741916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0429  sensor histidine kinase FeuQ  34.68 
 
 		 473 aa  263  4.999999999999999e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 446 aa  262  8.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  40.49 
 
 		 456 aa  262  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  46.44 
 
 		 317 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 453 aa  257  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 445 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  33.33 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  38.84 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 439 aa  233  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  37.1 
 
 		 448 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  36.64 
 
 		 448 aa  229  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 474 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 456 aa  223  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  34.64 
 
 		 474 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 441 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 450 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 460 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 452 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  33.55 
 
 		 456 aa  210  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 484 aa  207  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 458 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 454 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 447 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0300234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  34.43 
 
 		 471 aa  196  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  31.92 
 
 		 482 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 482 aa  193  5e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4325  hypothetical protein  36.3 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.36321 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  31.73 
 
 		 456 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  31.21 
 
 		 469 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  34.11 
 
 		 429 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3778  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 462 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 442 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  35.14 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  34.73 
 
 		 445 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 439 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 454 aa  186  9e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 454 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526543  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 442 aa  183  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 442 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  32.9 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2841  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4141  histidine kinase  31.79 
 
 		 454 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  32.68 
 
 		 442 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  28.16 
 
 		 475 aa  180  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 442 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3007  sensor histidine kinase  32.42 
 
 		 445 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  32.24 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1957  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0083917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0203  two component sensor kinase  30.59 
 
 		 451 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 442 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 441 aa  176  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  32.01 
 
 		 466 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 444 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183643  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4648  sensor histidine kinase  31.63 
 
 		 454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4026  ATPase domain-containing protein  31.88 
 
 		 454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  30.18 
 
 		 441 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1263  ATP-binding region, ATPase-like protein  30.23 
 
 		 474 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000081586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>